More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2359 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 
794 aa  1617    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  39.89 
 
 
775 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  38.14 
 
 
783 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  36.14 
 
 
772 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  35.81 
 
 
767 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  35.62 
 
 
798 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  36.7 
 
 
795 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  31.97 
 
 
784 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  33.11 
 
 
759 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  32.59 
 
 
796 aa  375  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  30.89 
 
 
753 aa  348  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  27.82 
 
 
822 aa  311  2e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  27.73 
 
 
786 aa  311  4e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  27.63 
 
 
802 aa  301  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  26.53 
 
 
815 aa  290  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  27.31 
 
 
815 aa  270  7e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  26.14 
 
 
800 aa  270  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  28.07 
 
 
790 aa  260  6e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2078  capsular exopolysaccharide family  25.65 
 
 
800 aa  232  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.325756 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.1 
 
 
804 aa  226  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  25.4 
 
 
806 aa  213  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  24.17 
 
 
767 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  24.24 
 
 
820 aa  185  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  24.23 
 
 
734 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  24.72 
 
 
740 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  22.8 
 
 
746 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  26.54 
 
 
730 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  23.28 
 
 
726 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  24.73 
 
 
744 aa  174  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  21.38 
 
 
732 aa  174  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  24.76 
 
 
741 aa  173  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  22.98 
 
 
734 aa  172  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  25.04 
 
 
722 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  24.17 
 
 
755 aa  167  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  23.5 
 
 
744 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  23.01 
 
 
736 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.84 
 
 
736 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 
737 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  32.87 
 
 
503 aa  164  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  21.02 
 
 
739 aa  163  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2664  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.53 
 
 
345 aa  163  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933952  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  21.02 
 
 
739 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.49 
 
 
741 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  25.58 
 
 
753 aa  161  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.71 
 
 
741 aa  162  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  21.14 
 
 
739 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.15 
 
 
730 aa  161  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  34.4 
 
 
484 aa  160  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  24.59 
 
 
741 aa  160  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  21.47 
 
 
739 aa  160  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  26.1 
 
 
740 aa  160  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  26.06 
 
 
740 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  23.41 
 
 
754 aa  159  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  29.64 
 
 
454 aa  158  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  24.36 
 
 
741 aa  158  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  22.58 
 
 
727 aa  158  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  23.36 
 
 
751 aa  157  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  24.38 
 
 
747 aa  157  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 
738 aa  156  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  23.33 
 
 
759 aa  156  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 
731 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  22.97 
 
 
735 aa  156  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  23.38 
 
 
740 aa  156  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 
730 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  24.38 
 
 
745 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  27.69 
 
 
496 aa  154  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  24.48 
 
 
746 aa  154  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  25 
 
 
803 aa  154  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  22.85 
 
 
797 aa  153  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  22.54 
 
 
721 aa  152  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  24.14 
 
 
746 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.04 
 
 
720 aa  152  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  34.19 
 
 
466 aa  152  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  32.99 
 
 
508 aa  151  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  26.02 
 
 
747 aa  151  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  23.92 
 
 
720 aa  151  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  23.92 
 
 
720 aa  151  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.38 
 
 
734 aa  150  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  23.92 
 
 
720 aa  150  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  23.92 
 
 
720 aa  150  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  23.92 
 
 
720 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  23.33 
 
 
720 aa  150  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  23.72 
 
 
749 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  23.66 
 
 
720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  26.37 
 
 
527 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  24.88 
 
 
736 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  23.66 
 
 
720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  25.6 
 
 
748 aa  149  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 
463 aa  148  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  22.88 
 
 
724 aa  148  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  22.22 
 
 
753 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  22.1 
 
 
744 aa  147  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  23.56 
 
 
720 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  27.27 
 
 
731 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  24.86 
 
 
756 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  31.9 
 
 
667 aa  146  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  35.76 
 
 
473 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  22.79 
 
 
745 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  23.73 
 
 
719 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  24.12 
 
 
719 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>