More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6398 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 
775 aa  1578    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  57.14 
 
 
783 aa  894    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  53.86 
 
 
767 aa  851    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  40.87 
 
 
772 aa  576  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  39.89 
 
 
794 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  41.02 
 
 
795 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  34.78 
 
 
798 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  35.46 
 
 
759 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  32.38 
 
 
784 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  31.61 
 
 
796 aa  380  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  30.27 
 
 
786 aa  355  2e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  30.42 
 
 
822 aa  343  5e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  30.13 
 
 
753 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  28.65 
 
 
815 aa  306  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  26.74 
 
 
815 aa  292  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  28.81 
 
 
800 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  24.9 
 
 
802 aa  283  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2078  capsular exopolysaccharide family  27.26 
 
 
800 aa  246  8e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.325756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  24.93 
 
 
790 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 
804 aa  225  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  25.03 
 
 
820 aa  208  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  21.21 
 
 
767 aa  195  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2664  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.84 
 
 
345 aa  193  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933952  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  23.77 
 
 
806 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  23.51 
 
 
730 aa  187  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  24.97 
 
 
723 aa  181  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  27.51 
 
 
746 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  24.81 
 
 
734 aa  177  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  25.38 
 
 
733 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  23.8 
 
 
726 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.65 
 
 
720 aa  176  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.21 
 
 
730 aa  172  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  23.42 
 
 
740 aa  171  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  23.73 
 
 
736 aa  170  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  24.7 
 
 
745 aa  167  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  23.03 
 
 
736 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  24.87 
 
 
747 aa  165  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  24.53 
 
 
746 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  21.88 
 
 
741 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  36.9 
 
 
508 aa  164  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  23.42 
 
 
759 aa  163  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  30.16 
 
 
464 aa  163  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  22.61 
 
 
753 aa  161  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  22.43 
 
 
740 aa  161  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  24.77 
 
 
746 aa  160  9e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0611  protein-tyrosine kinase  22.71 
 
 
753 aa  159  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  23.59 
 
 
748 aa  160  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  22.99 
 
 
736 aa  159  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  37.72 
 
 
443 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  24.46 
 
 
747 aa  159  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  36.43 
 
 
505 aa  158  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  37.72 
 
 
497 aa  159  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  23.12 
 
 
721 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  26.68 
 
 
740 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  22.06 
 
 
740 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  24 
 
 
751 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  23.41 
 
 
716 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  35.11 
 
 
466 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  23.55 
 
 
734 aa  154  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  33 
 
 
454 aa  154  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.41 
 
 
730 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  29.62 
 
 
747 aa  153  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  23.17 
 
 
731 aa  153  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.47 
 
 
736 aa  153  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  25.26 
 
 
749 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  22.56 
 
 
747 aa  151  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  21.95 
 
 
739 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  36.08 
 
 
463 aa  149  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  24.06 
 
 
753 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  22.01 
 
 
739 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  26.85 
 
 
743 aa  147  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  22.01 
 
 
739 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  24.1 
 
 
757 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  28.57 
 
 
719 aa  147  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  33.78 
 
 
472 aa  147  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  23.25 
 
 
741 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  28.04 
 
 
719 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  22.38 
 
 
744 aa  147  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  23.89 
 
 
739 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 
730 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  22.39 
 
 
727 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  22.85 
 
 
745 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  27.78 
 
 
719 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.76 
 
 
770 aa  145  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  27.78 
 
 
719 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  27.78 
 
 
719 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.24 
 
 
741 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  22.69 
 
 
732 aa  144  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  24.05 
 
 
797 aa  144  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  28.31 
 
 
720 aa  144  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  22 
 
 
744 aa  144  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  28.31 
 
 
720 aa  144  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  28.31 
 
 
720 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  28.04 
 
 
720 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  21.79 
 
 
735 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  28.31 
 
 
720 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  28.31 
 
 
720 aa  143  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  31.65 
 
 
529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  34.83 
 
 
615 aa  142  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  22.75 
 
 
746 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>