More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1045 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 
736 aa  1488    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  42.15 
 
 
734 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  41.24 
 
 
722 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  39.22 
 
 
742 aa  513  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  39.16 
 
 
741 aa  492  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  32.33 
 
 
727 aa  321  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  29.32 
 
 
750 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  29.88 
 
 
753 aa  267  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  29.52 
 
 
763 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.34 
 
 
720 aa  259  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  29.18 
 
 
804 aa  231  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  29.26 
 
 
741 aa  229  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  29.13 
 
 
790 aa  229  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  27.99 
 
 
753 aa  225  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 
778 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.93 
 
 
730 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  25.5 
 
 
745 aa  217  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  25.5 
 
 
739 aa  213  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  36.42 
 
 
464 aa  211  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  27.91 
 
 
743 aa  211  6e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25 
 
 
756 aa  208  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  25.29 
 
 
803 aa  205  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  26.08 
 
 
779 aa  205  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  26.65 
 
 
790 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.55 
 
 
743 aa  200  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  27.59 
 
 
806 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  27.55 
 
 
734 aa  197  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  27.81 
 
 
740 aa  191  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  26.75 
 
 
739 aa  191  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.83 
 
 
741 aa  191  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1925  protein-tyrosine kinase  28.08 
 
 
801 aa  191  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864288  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  27.58 
 
 
741 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  24.92 
 
 
815 aa  189  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  26.27 
 
 
739 aa  188  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  25.84 
 
 
772 aa  187  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  26.27 
 
 
739 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  26.34 
 
 
722 aa  187  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  26.94 
 
 
721 aa  187  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  27.83 
 
 
734 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  26.6 
 
 
719 aa  185  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  26.55 
 
 
719 aa  185  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  25.21 
 
 
721 aa  185  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  26.48 
 
 
719 aa  185  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  26.48 
 
 
719 aa  185  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  26.84 
 
 
741 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  25.57 
 
 
724 aa  184  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  26.48 
 
 
719 aa  183  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  27.14 
 
 
720 aa  183  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  27.29 
 
 
720 aa  183  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  27.08 
 
 
716 aa  182  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  26.85 
 
 
720 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  26.85 
 
 
720 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  27.14 
 
 
720 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.58 
 
 
741 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  26.85 
 
 
720 aa  181  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  30.58 
 
 
741 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  31.33 
 
 
739 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  30.58 
 
 
741 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  26.97 
 
 
720 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  26.97 
 
 
720 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.87 
 
 
741 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  26.8 
 
 
720 aa  180  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  26.71 
 
 
820 aa  179  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  26.06 
 
 
786 aa  180  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  25.65 
 
 
726 aa  179  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  30.23 
 
 
726 aa  178  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.23 
 
 
726 aa  178  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  27.36 
 
 
745 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  23.5 
 
 
775 aa  178  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.23 
 
 
726 aa  178  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.23 
 
 
726 aa  178  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  30.23 
 
 
726 aa  178  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.23 
 
 
726 aa  178  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.23 
 
 
726 aa  178  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.23 
 
 
726 aa  178  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  26.35 
 
 
734 aa  177  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.04 
 
 
739 aa  177  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  26.33 
 
 
731 aa  177  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  23.55 
 
 
737 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  24.72 
 
 
755 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  27.36 
 
 
747 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  27.36 
 
 
746 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  25.69 
 
 
724 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  26.75 
 
 
746 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 
731 aa  175  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  25.03 
 
 
803 aa  175  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  26.96 
 
 
749 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  24.91 
 
 
684 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  23.98 
 
 
797 aa  173  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  25.65 
 
 
766 aa  173  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 
738 aa  172  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  25.55 
 
 
756 aa  171  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  33.94 
 
 
496 aa  171  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  24.62 
 
 
802 aa  171  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  24.06 
 
 
798 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.2 
 
 
730 aa  169  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  22.98 
 
 
795 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2688  lipopolysaccharide biosynthesis  26.06 
 
 
731 aa  168  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.86 
 
 
575 aa  168  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  37.29 
 
 
454 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>