More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2688 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2688  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 
731 aa  1472    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2908  lipopolysaccharide biosynthesis  44.63 
 
 
727 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000198552 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0828  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.38 
 
 
726 aa  519  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.490846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2514  lipopolysaccharide biosynthesis protein  40.31 
 
 
735 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3592  chromosome partitioning ATPase  40.31 
 
 
735 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.857292  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.24 
 
 
720 aa  176  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  26.06 
 
 
736 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  24.88 
 
 
722 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  23.2 
 
 
734 aa  141  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  23.86 
 
 
727 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  24.37 
 
 
742 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  23.97 
 
 
753 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3415  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 
751 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2701  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 
751 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.431033  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  23.78 
 
 
763 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1925  protein-tyrosine kinase  26.28 
 
 
801 aa  116  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864288  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 
804 aa  114  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 
730 aa  114  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  23 
 
 
741 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  24.43 
 
 
739 aa  108  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  23.43 
 
 
795 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  26.15 
 
 
815 aa  105  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  23.84 
 
 
684 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  31.5 
 
 
464 aa  103  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  21.74 
 
 
790 aa  102  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  22.42 
 
 
794 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  25.49 
 
 
772 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  26.38 
 
 
624 aa  99  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  28.47 
 
 
496 aa  99  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  21.56 
 
 
820 aa  99  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.43 
 
 
759 aa  98.6  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  22.48 
 
 
743 aa  98.2  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  22.39 
 
 
721 aa  97.8  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  31.53 
 
 
246 aa  95.9  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  24.94 
 
 
741 aa  96.3  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  29.12 
 
 
778 aa  94.7  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  26.02 
 
 
783 aa  94.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  24.29 
 
 
784 aa  94.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  22.59 
 
 
779 aa  93.2  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  29.74 
 
 
466 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 
737 aa  92.8  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  28.01 
 
 
798 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  21.82 
 
 
750 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 
778 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  26.44 
 
 
492 aa  91.3  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  30.92 
 
 
463 aa  91.3  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  23.32 
 
 
770 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  24.31 
 
 
741 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0240  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 
760 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0345486 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  27.04 
 
 
778 aa  90.1  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  29.39 
 
 
753 aa  89.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  31.78 
 
 
795 aa  89.7  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  22.95 
 
 
786 aa  89.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  31.22 
 
 
803 aa  89  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  23.72 
 
 
775 aa  87.4  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  22.05 
 
 
759 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0764  protein-tyrosine kinase  35.26 
 
 
763 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0280941  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  25.04 
 
 
790 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.12 
 
 
739 aa  85.9  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  28.33 
 
 
474 aa  85.5  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  23.81 
 
 
796 aa  85.1  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  25.15 
 
 
815 aa  85.1  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  22.48 
 
 
756 aa  84.7  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  29.02 
 
 
764 aa  84.7  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4516  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 
740 aa  84.3  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265427  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  32.24 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  32.18 
 
 
497 aa  84.3  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.31 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.37 
 
 
217 aa  84  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  31.25 
 
 
766 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  31.71 
 
 
753 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  30.53 
 
 
217 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1172  cpsD protein  27.78 
 
 
229 aa  82.8  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.748604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  32.57 
 
 
490 aa  82.8  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.82 
 
 
240 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  28.97 
 
 
503 aa  82.8  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  29.07 
 
 
505 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  30.56 
 
 
803 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  28.57 
 
 
484 aa  82  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  22.66 
 
 
767 aa  81.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.1 
 
 
474 aa  81.6  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  27.64 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  29.13 
 
 
539 aa  80.9  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  27.8 
 
 
734 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  31.78 
 
 
615 aa  80.5  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  31.98 
 
 
667 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  28.64 
 
 
225 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  32.56 
 
 
508 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.63 
 
 
225 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  20.65 
 
 
806 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  29.63 
 
 
225 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  21.77 
 
 
802 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  29.67 
 
 
492 aa  79  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  25 
 
 
738 aa  79  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  30.43 
 
 
585 aa  79.3  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.05 
 
 
720 aa  78.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  31.77 
 
 
509 aa  78.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  28.42 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  25.87 
 
 
800 aa  78.2  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  30.88 
 
 
772 aa  78.2  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>