More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3321 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  50.8 
 
 
779 aa  726    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 
772 aa  1579    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  32.32 
 
 
753 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  30.75 
 
 
745 aa  352  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  30.39 
 
 
730 aa  336  7.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  30.54 
 
 
797 aa  328  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  30.47 
 
 
727 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  30.41 
 
 
721 aa  295  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  29.99 
 
 
737 aa  294  4e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  27.56 
 
 
743 aa  270  8e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 
737 aa  265  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  28.86 
 
 
756 aa  259  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  26.6 
 
 
790 aa  252  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  25.57 
 
 
755 aa  245  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  25.7 
 
 
756 aa  239  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 
804 aa  229  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  25.67 
 
 
711 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.07 
 
 
738 aa  229  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.63 
 
 
739 aa  228  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  25.21 
 
 
733 aa  226  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  25.3 
 
 
726 aa  223  9e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.28 
 
 
731 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 
745 aa  221  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.93 
 
 
806 aa  220  7e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  26.42 
 
 
774 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  25.36 
 
 
770 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  25.14 
 
 
756 aa  213  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 
738 aa  208  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.87 
 
 
734 aa  207  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  27.99 
 
 
872 aa  202  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  24.75 
 
 
750 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  25.56 
 
 
736 aa  196  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  36.48 
 
 
464 aa  195  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.84 
 
 
467 aa  195  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  23.35 
 
 
734 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  25.54 
 
 
766 aa  193  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  30.6 
 
 
466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  25.34 
 
 
758 aa  190  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.25 
 
 
575 aa  187  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  24.81 
 
 
741 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  24.3 
 
 
753 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  30.08 
 
 
472 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  24.4 
 
 
803 aa  185  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  23.44 
 
 
710 aa  184  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  25.17 
 
 
758 aa  183  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  25.29 
 
 
750 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  28.2 
 
 
527 aa  180  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.48 
 
 
739 aa  179  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.42 
 
 
722 aa  179  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.8 
 
 
720 aa  177  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  24.75 
 
 
763 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  23.45 
 
 
739 aa  173  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  34.88 
 
 
529 aa  170  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  25.66 
 
 
732 aa  170  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  24.62 
 
 
803 aa  169  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  25.92 
 
 
740 aa  169  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  33.97 
 
 
521 aa  169  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 
764 aa  167  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  34.64 
 
 
454 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  31.09 
 
 
505 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.57 
 
 
720 aa  165  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  30.82 
 
 
667 aa  164  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.74 
 
 
741 aa  164  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  24.24 
 
 
790 aa  164  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  27.09 
 
 
786 aa  162  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  24.94 
 
 
722 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  23.62 
 
 
772 aa  161  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  31.37 
 
 
508 aa  162  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.92 
 
 
741 aa  161  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  25.92 
 
 
741 aa  161  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  25.92 
 
 
741 aa  161  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  25.35 
 
 
795 aa  160  9e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  25.22 
 
 
739 aa  159  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  36.75 
 
 
492 aa  159  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0519  capsular exopolysaccharide family  24.9 
 
 
819 aa  158  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  23 
 
 
778 aa  158  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  25.22 
 
 
741 aa  157  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  25.39 
 
 
741 aa  157  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  27.16 
 
 
815 aa  157  7e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.39 
 
 
741 aa  157  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  22.72 
 
 
788 aa  157  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  35.09 
 
 
490 aa  157  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  23.81 
 
 
742 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  33.77 
 
 
492 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  31.03 
 
 
739 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  31.03 
 
 
739 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  31.03 
 
 
739 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  40.71 
 
 
217 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  32.35 
 
 
503 aa  155  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  40.27 
 
 
217 aa  154  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  23.73 
 
 
767 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  29.82 
 
 
466 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  24.45 
 
 
772 aa  152  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.44 
 
 
726 aa  151  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.44 
 
 
726 aa  151  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  22.44 
 
 
726 aa  151  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.44 
 
 
726 aa  151  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.44 
 
 
726 aa  151  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  22.44 
 
 
726 aa  151  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.44 
 
 
726 aa  151  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>