More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1977 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  76.68 
 
 
803 aa  1203    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  55.6 
 
 
795 aa  831    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 
803 aa  1653    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0519  capsular exopolysaccharide family  40.62 
 
 
819 aa  570  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  40.71 
 
 
814 aa  569  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350341  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0764  protein-tyrosine kinase  38.13 
 
 
763 aa  483  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0280941  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  27.77 
 
 
790 aa  248  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 
804 aa  243  9e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  26.21 
 
 
790 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.66 
 
 
730 aa  219  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  25.13 
 
 
734 aa  217  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.87 
 
 
720 aa  216  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  26.86 
 
 
741 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.65 
 
 
806 aa  211  5e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  25.96 
 
 
736 aa  204  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  27.26 
 
 
753 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25.74 
 
 
756 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  24.4 
 
 
772 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  23.69 
 
 
779 aa  185  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  32.15 
 
 
496 aa  181  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  25.73 
 
 
774 aa  180  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  24.65 
 
 
750 aa  177  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  26.81 
 
 
742 aa  175  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.11 
 
 
743 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  24.58 
 
 
820 aa  174  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  25.59 
 
 
722 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  23.44 
 
 
721 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  30.37 
 
 
745 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  30.18 
 
 
746 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  28.02 
 
 
464 aa  171  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  24.58 
 
 
747 aa  170  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  30.18 
 
 
747 aa  170  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  23.86 
 
 
783 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  27.46 
 
 
786 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  24.06 
 
 
726 aa  166  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.72 
 
 
235 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.62 
 
 
755 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  32.08 
 
 
521 aa  164  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  22.25 
 
 
795 aa  164  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  24.87 
 
 
736 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  39.23 
 
 
217 aa  164  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 
731 aa  163  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.23 
 
 
217 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  22.18 
 
 
772 aa  162  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 
745 aa  162  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  29.52 
 
 
802 aa  161  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  25.49 
 
 
734 aa  160  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.63 
 
 
726 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  30.63 
 
 
726 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.63 
 
 
726 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.63 
 
 
726 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.63 
 
 
726 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  30.63 
 
 
726 aa  159  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  28.35 
 
 
719 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  29.78 
 
 
726 aa  159  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.63 
 
 
726 aa  159  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  30.63 
 
 
726 aa  159  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  28.41 
 
 
719 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  24.54 
 
 
745 aa  158  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  41.97 
 
 
246 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  24.75 
 
 
794 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  28.41 
 
 
719 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  23.35 
 
 
737 aa  157  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  28.41 
 
 
719 aa  157  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  28.41 
 
 
719 aa  157  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  31.88 
 
 
723 aa  156  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  41.84 
 
 
211 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  23.37 
 
 
734 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  32.92 
 
 
505 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 
738 aa  154  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  25.22 
 
 
784 aa  154  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  31.2 
 
 
529 aa  154  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  29.66 
 
 
734 aa  154  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  31.22 
 
 
720 aa  153  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  31.59 
 
 
723 aa  153  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.2 
 
 
736 aa  153  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  31.99 
 
 
466 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  29.1 
 
 
454 aa  152  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  37.79 
 
 
252 aa  152  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  23.03 
 
 
756 aa  151  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  34.15 
 
 
508 aa  151  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  28.57 
 
 
815 aa  151  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  22.7 
 
 
727 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  43.39 
 
 
492 aa  151  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.02 
 
 
741 aa  150  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  29.98 
 
 
720 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  29.98 
 
 
720 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  28.02 
 
 
741 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  29.73 
 
 
720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  23.06 
 
 
770 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  40.09 
 
 
472 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  31.69 
 
 
524 aa  149  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  31.89 
 
 
503 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.61 
 
 
741 aa  148  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  24.7 
 
 
751 aa  148  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.59 
 
 
575 aa  149  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  29.73 
 
 
720 aa  148  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  29.73 
 
 
720 aa  148  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.12 
 
 
741 aa  148  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  28.12 
 
 
741 aa  148  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>