More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4764 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 
798 aa  1626    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  34.52 
 
 
783 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  35.62 
 
 
794 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  34.78 
 
 
775 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  33.6 
 
 
767 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  33.15 
 
 
753 aa  446  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  33.38 
 
 
759 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  33.16 
 
 
772 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  34.56 
 
 
795 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  34.04 
 
 
796 aa  414  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  32.1 
 
 
784 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  31.96 
 
 
786 aa  389  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  28.22 
 
 
822 aa  340  7e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  26.32 
 
 
800 aa  295  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  26.79 
 
 
815 aa  290  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  27.01 
 
 
815 aa  277  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  26.34 
 
 
802 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.39 
 
 
804 aa  259  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  26.1 
 
 
790 aa  243  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2078  capsular exopolysaccharide family  24.97 
 
 
800 aa  238  4e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.325756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  24.49 
 
 
767 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  24.12 
 
 
720 aa  201  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  23.99 
 
 
720 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  23.99 
 
 
720 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  23.87 
 
 
720 aa  198  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  23.99 
 
 
720 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  23.87 
 
 
720 aa  197  9e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  23.87 
 
 
720 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  23.87 
 
 
720 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  23.29 
 
 
716 aa  194  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  24.03 
 
 
720 aa  193  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  23.81 
 
 
719 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  23.3 
 
 
734 aa  192  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  24.24 
 
 
719 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  23.81 
 
 
719 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  25.45 
 
 
719 aa  192  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  23.81 
 
 
719 aa  191  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  23.9 
 
 
730 aa  188  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  24.12 
 
 
724 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  23.55 
 
 
747 aa  187  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  23.86 
 
 
806 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  24.85 
 
 
739 aa  185  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  21.88 
 
 
726 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  24.85 
 
 
739 aa  184  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  24.6 
 
 
739 aa  183  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  25.41 
 
 
746 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  25.82 
 
 
747 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  24.72 
 
 
739 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  23.3 
 
 
723 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  23.13 
 
 
734 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.93 
 
 
720 aa  177  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  23.46 
 
 
746 aa  177  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  23.61 
 
 
741 aa  177  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.61 
 
 
741 aa  177  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  23.26 
 
 
741 aa  177  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  23.61 
 
 
741 aa  177  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  23.32 
 
 
721 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  23.08 
 
 
746 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.13 
 
 
741 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  22.43 
 
 
727 aa  174  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  22.78 
 
 
759 aa  174  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  22.28 
 
 
741 aa  174  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  22.95 
 
 
722 aa  174  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  24.94 
 
 
735 aa  173  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  23.4 
 
 
755 aa  173  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  22.48 
 
 
748 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.47 
 
 
741 aa  171  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  25.06 
 
 
753 aa  171  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0611  protein-tyrosine kinase  22.98 
 
 
753 aa  170  8e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  23.09 
 
 
741 aa  170  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  25.5 
 
 
743 aa  170  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  22.84 
 
 
744 aa  170  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  22.48 
 
 
753 aa  169  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4097  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.28 
 
 
760 aa  168  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139817  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  22.6 
 
 
736 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  22.66 
 
 
726 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.66 
 
 
726 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  22.35 
 
 
744 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3622  hypothetical protein  23.16 
 
 
760 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  21.9 
 
 
740 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.66 
 
 
726 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.66 
 
 
726 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  24.07 
 
 
749 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  22.66 
 
 
726 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.66 
 
 
726 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  21.93 
 
 
750 aa  166  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.66 
 
 
726 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.66 
 
 
726 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  25.41 
 
 
745 aa  165  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.39 
 
 
726 aa  165  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  23.82 
 
 
724 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  22.78 
 
 
820 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.52 
 
 
730 aa  164  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  23.1 
 
 
751 aa  164  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  22.57 
 
 
723 aa  164  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  24.83 
 
 
736 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  25.13 
 
 
747 aa  162  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  28.77 
 
 
496 aa  161  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  21.78 
 
 
740 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  21.78 
 
 
733 aa  158  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>