More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4310 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 		 753 aa  1529    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  36.78 
 
 		 763 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  35.12 
 
 		 739 aa  411  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1925  protein-tyrosine kinase  34.21 
 
 		 801 aa  385  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864288  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0240  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.75 
 
 		 760 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0345486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2153  capsular exopolysaccharide family  32.66 
 
 		 713 aa  332  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2701  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.89 
 
 		 751 aa  313  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.431033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3415  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.61 
 
 		 751 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  29.79 
 
 		 743 aa  303  9e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  30.42 
 
 		 741 aa  299  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.82 
 
 		 478 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1507  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.86 
 
 		 478 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  28.31 
 
 		 684 aa  278  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  27.57 
 
 		 750 aa  271  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  29.48 
 
 		 736 aa  257  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  26.88 
 
 		 734 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4516  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.55 
 
 		 740 aa  243  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265427  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  27.62 
 
 		 742 aa  240  8e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13861  hypothetical protein  25.78 
 
 		 780 aa  230  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.832923  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.07 
 
 		 778 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  25.57 
 
 		 722 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  26.34 
 
 		 741 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  26.85 
 
 		 727 aa  191  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.22 
 
 		 720 aa  174  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 730 aa  174  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  24.56 
 
 		 790 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 804 aa  160  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  22.25 
 
 		 756 aa  160  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  23.8 
 
 		 753 aa  154  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  23.03 
 
 		 756 aa  153  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.01 
 
 		 743 aa  147  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  32.6 
 
 		 496 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  23.5 
 
 		 721 aa  144  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.83 
 
 		 779 aa  144  8e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  29.02 
 
 		 667 aa  143  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  31.14 
 
 		 505 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.46 
 
 		 463 aa  140  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  30.72 
 
 		 508 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  30.38 
 
 		 466 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  22.91 
 
 		 772 aa  137  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  23 
 
 		 795 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  21.85 
 
 		 806 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  26.46 
 
 		 796 aa  136  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  26.87 
 
 		 727 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  22.06 
 
 		 755 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  23.52 
 
 		 803 aa  134  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  33.66 
 
 		 472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  29.45 
 
 		 521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  23.97 
 
 		 802 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  21.83 
 
 		 802 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  23.78 
 
 		 738 aa  131  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2908  lipopolysaccharide biosynthesis  21.63 
 
 		 727 aa  131  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000198552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  30.61 
 
 		 529 aa  131  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  25.7 
 
 		 734 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.06 
 
 		 739 aa  127  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 		 474 aa  127  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  20.75 
 
 		 738 aa  126  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  26.99 
 
 		 734 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2688  lipopolysaccharide biosynthesis  23.97 
 
 		 731 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  30.18 
 
 		 474 aa  126  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  22.81 
 
 		 758 aa  126  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  22.37 
 
 		 797 aa  125  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  30.62 
 
 		 615 aa  125  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  32.76 
 
 		 503 aa  125  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.65 
 
 		 235 aa  124  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  20.79 
 
 		 711 aa  124  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5359  protein-tyrosine kinase  24.65 
 
 		 800 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  22.49 
 
 		 790 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  30.17 
 
 		 454 aa  122  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.11 
 
 		 726 aa  122  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  23.36 
 
 		 784 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  30.72 
 
 		 443 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  23.55 
 
 		 786 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  30.72 
 
 		 497 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  20.92 
 
 		 784 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  20.34 
 
 		 794 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  26.8 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.35 
 
 		 575 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  36.36 
 
 		 492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  37.06 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  23.98 
 
 		 784 aa  119  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 745 aa  118  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  36.55 
 
 		 217 aa  118  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  29.39 
 
 		 524 aa  119  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  26.61 
 
 		 740 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  31.86 
 
 		 509 aa  118  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  34.55 
 
 		 257 aa  117  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  33.83 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  29.24 
 
 		 490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  21.33 
 
 		 746 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  22.63 
 
 		 758 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  21.4 
 
 		 767 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  21.85 
 
 		 741 aa  114  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  28.62 
 
 		 766 aa  114  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  20.75 
 
 		 815 aa  113  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3592  chromosome partitioning ATPase  24.47 
 
 		 735 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.857292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2514  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 735 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  22.22 
 
 		 741 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  26.63 
 
 		 624 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.73 
 
 		 726 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>