More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1116 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 741 aa  1496    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  77.12 
 
 		 743 aa  1170    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  39.51 
 
 		 684 aa  458  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4516  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.45 
 
 		 740 aa  407  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265427  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  30.42 
 
 		 753 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  29.33 
 
 		 739 aa  291  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  30.07 
 
 		 763 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1925  protein-tyrosine kinase  28.9 
 
 		 801 aa  231  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864288  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2701  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 751 aa  225  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.431033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3415  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.85 
 
 		 751 aa  223  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0240  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.79 
 
 		 760 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0345486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2153  capsular exopolysaccharide family  27.99 
 
 		 713 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  29.16 
 
 		 736 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  26.98 
 
 		 750 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.97 
 
 		 778 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  26.2 
 
 		 734 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  25.58 
 
 		 742 aa  188  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  26.96 
 
 		 722 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  26.56 
 
 		 790 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13861  hypothetical protein  23.34 
 
 		 780 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.832923  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  24.73 
 
 		 741 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.58 
 
 		 478 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1507  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.58 
 
 		 478 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  24.93 
 
 		 727 aa  138  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  22.87 
 
 		 753 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  36.09 
 
 		 774 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2908  lipopolysaccharide biosynthesis  27.7 
 
 		 727 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000198552 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  23.49 
 
 		 737 aa  130  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.89 
 
 		 720 aa  129  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  24.41 
 
 		 797 aa  127  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.37 
 
 		 235 aa  125  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  30.22 
 
 		 464 aa  125  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  23.52 
 
 		 756 aa  124  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  23.65 
 
 		 772 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  24.39 
 
 		 721 aa  119  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  23.54 
 
 		 779 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  24.13 
 
 		 739 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  24.3 
 
 		 739 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  24.3 
 
 		 739 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  24.3 
 
 		 739 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  26.07 
 
 		 803 aa  114  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  25.97 
 
 		 790 aa  114  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  23.35 
 
 		 750 aa  114  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  30.03 
 
 		 503 aa  114  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  26.95 
 
 		 727 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  26.48 
 
 		 667 aa  111  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  30.85 
 
 		 509 aa  111  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  22.61 
 
 		 743 aa  111  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  27.25 
 
 		 757 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  31.96 
 
 		 454 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  23.27 
 
 		 741 aa  110  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  21.25 
 
 		 711 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  30.95 
 
 		 217 aa  110  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  28.05 
 
 		 815 aa  109  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.25 
 
 		 720 aa  109  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.48 
 
 		 217 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  34.72 
 
 		 585 aa  108  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  31.58 
 
 		 463 aa  108  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  26.45 
 
 		 740 aa  108  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0828  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 		 726 aa  108  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.490846  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  28.62 
 
 		 484 aa  107  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  28.14 
 
 		 496 aa  107  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.51 
 
 		 228 aa  107  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.51 
 
 		 228 aa  107  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.25 
 
 		 726 aa  107  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  22.51 
 
 		 802 aa  107  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  29.05 
 
 		 737 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  28.91 
 
 		 527 aa  106  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  22.25 
 
 		 753 aa  105  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.63 
 
 		 741 aa  106  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  25.17 
 
 		 736 aa  105  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  26.45 
 
 		 508 aa  105  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 		 804 aa  105  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  32.66 
 
 		 246 aa  105  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  27.75 
 
 		 755 aa  105  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  25.83 
 
 		 732 aa  103  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  25.86 
 
 		 726 aa  103  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.97 
 
 		 726 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.97 
 
 		 726 aa  103  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  25.97 
 
 		 726 aa  103  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.97 
 
 		 726 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.97 
 
 		 726 aa  103  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.97 
 
 		 726 aa  103  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  26.76 
 
 		 721 aa  103  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  25.97 
 
 		 726 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  28.1 
 
 		 472 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.97 
 
 		 726 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.56 
 
 		 741 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  24.56 
 
 		 741 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  24.56 
 
 		 741 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.61 
 
 		 220 aa  102  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  28.35 
 
 		 474 aa  102  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  25.19 
 
 		 624 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.41 
 
 		 739 aa  102  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  34.95 
 
 		 232 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  26.45 
 
 		 466 aa  101  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  31.66 
 
 		 233 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  32.16 
 
 		 233 aa  101  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  31.63 
 
 		 257 aa  101  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  28.29 
 
 		 738 aa  100  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>