More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0852 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 
727 aa  1447    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  32.33 
 
 
736 aa  326  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  29.71 
 
 
742 aa  301  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  31.11 
 
 
722 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  28.87 
 
 
734 aa  266  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  27.99 
 
 
750 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  27.09 
 
 
741 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  28.19 
 
 
790 aa  205  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  26.23 
 
 
763 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  27.97 
 
 
806 aa  200  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  26.85 
 
 
753 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.76 
 
 
720 aa  195  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  34.38 
 
 
464 aa  187  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.3 
 
 
804 aa  183  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2908  lipopolysaccharide biosynthesis  29.13 
 
 
727 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000198552 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0519  capsular exopolysaccharide family  26.6 
 
 
819 aa  173  9e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  27.15 
 
 
803 aa  173  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  25.04 
 
 
803 aa  171  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 
778 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.79 
 
 
739 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 
730 aa  165  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  25.85 
 
 
820 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.97 
 
 
743 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  26.09 
 
 
778 aa  159  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  22.81 
 
 
814 aa  157  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350341  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  25.04 
 
 
759 aa  156  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  37.11 
 
 
529 aa  157  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  29.56 
 
 
723 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.37 
 
 
711 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1925  protein-tyrosine kinase  24.9 
 
 
801 aa  156  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864288  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  25.64 
 
 
795 aa  155  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  23.23 
 
 
721 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  24.71 
 
 
739 aa  154  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  25.17 
 
 
756 aa  154  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  36.08 
 
 
521 aa  154  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  24.27 
 
 
753 aa  153  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 
745 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3592  chromosome partitioning ATPase  27.3 
 
 
735 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.857292  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2514  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.3 
 
 
735 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  24.62 
 
 
756 aa  151  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  26.3 
 
 
747 aa  151  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  28.93 
 
 
735 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  24.76 
 
 
738 aa  150  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  24.93 
 
 
741 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.29 
 
 
726 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0764  protein-tyrosine kinase  23.93 
 
 
763 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0280941  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.42 
 
 
741 aa  148  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  27.53 
 
 
755 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  27.47 
 
 
739 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  31.15 
 
 
734 aa  147  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  24.16 
 
 
743 aa  147  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  26.92 
 
 
741 aa  147  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.66 
 
 
739 aa  147  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  24.57 
 
 
815 aa  147  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  30.3 
 
 
740 aa  147  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  23.6 
 
 
795 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  27.63 
 
 
746 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  27.63 
 
 
746 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.23 
 
 
741 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  24.7 
 
 
753 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  25.23 
 
 
741 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  27.63 
 
 
746 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  25.23 
 
 
741 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  27.72 
 
 
753 aa  145  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.52 
 
 
737 aa  145  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  31.32 
 
 
744 aa  144  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  34.25 
 
 
505 aa  144  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  23.51 
 
 
734 aa  144  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.5 
 
 
722 aa  143  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  27.75 
 
 
733 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  26.69 
 
 
744 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 
731 aa  143  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2688  lipopolysaccharide biosynthesis  25 
 
 
731 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  27.47 
 
 
739 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  26.88 
 
 
753 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 
764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  27.2 
 
 
739 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  28.14 
 
 
741 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  27.2 
 
 
739 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  27.6 
 
 
741 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0828  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 
726 aa  141  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.490846  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2153  capsular exopolysaccharide family  24.65 
 
 
713 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428306  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  26.65 
 
 
740 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  24.28 
 
 
734 aa  142  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.6 
 
 
741 aa  142  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  25.97 
 
 
726 aa  141  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  26.32 
 
 
744 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  25.81 
 
 
756 aa  140  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  24.58 
 
 
684 aa  140  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  27.17 
 
 
746 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  24.03 
 
 
747 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  26.06 
 
 
740 aa  140  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  26.37 
 
 
732 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  24.77 
 
 
802 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3622  hypothetical protein  27.63 
 
 
760 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  26 
 
 
740 aa  138  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.64 
 
 
724 aa  138  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  24 
 
 
794 aa  138  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  28.39 
 
 
745 aa  137  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  30.51 
 
 
770 aa  137  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>