More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1681 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 
505 aa  1007    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  72.9 
 
 
497 aa  685    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  74.6 
 
 
466 aa  666    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  77.98 
 
 
508 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  79.17 
 
 
443 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  45.39 
 
 
490 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  41.26 
 
 
454 aa  334  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  42.4 
 
 
509 aa  332  8e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  41.32 
 
 
615 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  42.26 
 
 
472 aa  312  7.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  39.44 
 
 
503 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  41.56 
 
 
463 aa  311  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  37.78 
 
 
667 aa  310  5e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  40.91 
 
 
525 aa  302  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  38.72 
 
 
496 aa  295  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  38.67 
 
 
484 aa  288  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  36.79 
 
 
529 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  36.85 
 
 
521 aa  282  9e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  42.5 
 
 
473 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  37.08 
 
 
474 aa  257  4e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  33.07 
 
 
524 aa  246  6.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  35.9 
 
 
492 aa  243  7e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.98 
 
 
464 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  37.16 
 
 
492 aa  232  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  37.56 
 
 
438 aa  228  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  32.89 
 
 
492 aa  224  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  35 
 
 
477 aa  216  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  34.06 
 
 
453 aa  204  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.55 
 
 
482 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  33.23 
 
 
730 aa  192  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  36.14 
 
 
790 aa  190  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  32.81 
 
 
721 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  31.99 
 
 
539 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  36.01 
 
 
743 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  40.95 
 
 
217 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  40.48 
 
 
217 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  41.86 
 
 
232 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  33.06 
 
 
741 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  29.66 
 
 
755 aa  171  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  32.17 
 
 
736 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  41.56 
 
 
246 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  35.85 
 
 
779 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.37 
 
 
480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.14 
 
 
575 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  36.17 
 
 
753 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  34.87 
 
 
763 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  33.13 
 
 
734 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  32.32 
 
 
739 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  43.12 
 
 
239 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  33.45 
 
 
804 aa  162  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  39.05 
 
 
225 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  33.46 
 
 
257 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  32.06 
 
 
739 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  32.06 
 
 
739 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.97 
 
 
730 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  42 
 
 
240 aa  160  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  32.06 
 
 
739 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  32.04 
 
 
737 aa  160  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  36.88 
 
 
722 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  35.59 
 
 
745 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  37.39 
 
 
225 aa  159  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  37.16 
 
 
233 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  35.88 
 
 
746 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  36.43 
 
 
775 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  36.15 
 
 
747 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  38.74 
 
 
225 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  43.81 
 
 
235 aa  158  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.44 
 
 
220 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  31.97 
 
 
740 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  36.94 
 
 
225 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  35.31 
 
 
756 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.84 
 
 
225 aa  156  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.36 
 
 
230 aa  156  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.36 
 
 
230 aa  156  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  31.66 
 
 
732 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  35.37 
 
 
741 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  36.13 
 
 
766 aa  156  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.37 
 
 
741 aa  156  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  36.44 
 
 
233 aa  156  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  33.02 
 
 
745 aa  156  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  36.89 
 
 
233 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  36.89 
 
 
233 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  33.12 
 
 
727 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  39.69 
 
 
257 aa  155  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  38.73 
 
 
217 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.89 
 
 
234 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  32.04 
 
 
806 aa  154  5e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  31.86 
 
 
756 aa  154  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  33.57 
 
 
772 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  34.68 
 
 
741 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.69 
 
 
741 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  30.41 
 
 
738 aa  153  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  36.53 
 
 
233 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  41.98 
 
 
233 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.37 
 
 
741 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  33.92 
 
 
749 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  31.14 
 
 
469 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  35.37 
 
 
741 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  31.91 
 
 
750 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  35.37 
 
 
741 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>