More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0956 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 466 aa  926    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  77.75 
 
 		 508 aa  676    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  74.43 
 
 		 505 aa  666    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  72.51 
 
 		 497 aa  648    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  73.77 
 
 		 443 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  43.81 
 
 		 490 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  40.58 
 
 		 454 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  41.04 
 
 		 509 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  41.65 
 
 		 503 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  42.86 
 
 		 463 aa  316  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  42.89 
 
 		 472 aa  312  7.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  40.13 
 
 		 667 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  38.85 
 
 		 615 aa  288  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  39.6 
 
 		 496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  40.32 
 
 		 484 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  40.91 
 
 		 525 aa  276  8e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  41.45 
 
 		 473 aa  265  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  36.44 
 
 		 521 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  39.14 
 
 		 474 aa  262  8.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  34.41 
 
 		 529 aa  260  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  33.47 
 
 		 524 aa  241  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  31.83 
 
 		 464 aa  232  9e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  35.18 
 
 		 492 aa  230  4e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  36.43 
 
 		 492 aa  229  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  37.56 
 
 		 438 aa  219  7.999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  35.1 
 
 		 477 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  32.97 
 
 		 492 aa  213  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  32.23 
 
 		 730 aa  189  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  31.72 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  32.18 
 
 		 755 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  42.4 
 
 		 217 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  35.71 
 
 		 790 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.08 
 
 		 482 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  42.11 
 
 		 217 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  35.39 
 
 		 743 aa  172  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  44.17 
 
 		 246 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  29.9 
 
 		 539 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  29.17 
 
 		 721 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  37.67 
 
 		 225 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  33.54 
 
 		 734 aa  162  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  31.78 
 
 		 741 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.1 
 
 		 575 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  34.46 
 
 		 756 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  44.22 
 
 		 240 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  36.28 
 
 		 225 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  35.23 
 
 		 736 aa  161  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.88 
 
 		 741 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.08 
 
 		 730 aa  160  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  30.88 
 
 		 741 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  31.02 
 
 		 739 aa  159  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  31.74 
 
 		 732 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.25 
 
 		 741 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  34.98 
 
 		 804 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.13 
 
 		 741 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  31.74 
 
 		 722 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  31.13 
 
 		 741 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  31.13 
 
 		 741 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  31.25 
 
 		 739 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  32.41 
 
 		 734 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  31.74 
 
 		 740 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  31.25 
 
 		 739 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  31.25 
 
 		 739 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  36.74 
 
 		 225 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.74 
 
 		 225 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  31.55 
 
 		 738 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.33 
 
 		 230 aa  157  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  40.7 
 
 		 232 aa  156  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.33 
 
 		 230 aa  157  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  35.56 
 
 		 233 aa  156  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  30.15 
 
 		 741 aa  156  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  36.72 
 
 		 775 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  35.71 
 
 		 233 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  35.56 
 
 		 233 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  31.73 
 
 		 257 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  35.35 
 
 		 225 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.66 
 
 		 480 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  41.45 
 
 		 235 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.11 
 
 		 234 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  35.11 
 
 		 233 aa  153  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  35.11 
 
 		 233 aa  153  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  35.17 
 
 		 746 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  35.17 
 
 		 747 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  36.88 
 
 		 753 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  34.19 
 
 		 794 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  34.88 
 
 		 745 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  40.64 
 
 		 239 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  32.21 
 
 		 750 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  33.23 
 
 		 746 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  29.33 
 
 		 802 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  35.8 
 
 		 798 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  41.47 
 
 		 233 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  30.77 
 
 		 763 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  28.18 
 
 		 745 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  32.69 
 
 		 815 aa  147  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3000  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.59 
 
 		 242 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  31.67 
 
 		 746 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  31.4 
 
 		 779 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  35.64 
 
 		 766 aa  146  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  31.06 
 
 		 749 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.33 
 
 		 736 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>