More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3637 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 480 aa  951    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0501  lipopolysaccharide biosynthesis protein  64.11 
 
 		 488 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.056909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  33.68 
 
 		 605 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  33.49 
 
 		 505 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  33.19 
 
 		 624 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  32.56 
 
 		 469 aa  177  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.27 
 
 		 454 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  29.39 
 
 		 492 aa  170  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  32.52 
 
 		 466 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  33.49 
 
 		 497 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  32.72 
 
 		 490 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.35 
 
 		 575 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  29.31 
 
 		 667 aa  153  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  31.68 
 
 		 508 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  32.59 
 
 		 492 aa  150  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  24.72 
 
 		 464 aa  149  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  31.94 
 
 		 463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  31.6 
 
 		 615 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  29.72 
 
 		 503 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  29.48 
 
 		 484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  27.05 
 
 		 509 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  30.91 
 
 		 742 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  32.64 
 
 		 790 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  33.25 
 
 		 473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  33.07 
 
 		 443 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  27.29 
 
 		 521 aa  126  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  26.54 
 
 		 474 aa  124  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  30.37 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  27.33 
 
 		 529 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  30.5 
 
 		 525 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  27.95 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  32.41 
 
 		 722 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.67 
 
 		 221 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  28.83 
 
 		 496 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  28.18 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  32.11 
 
 		 233 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  26.3 
 
 		 736 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  28.43 
 
 		 804 aa  115  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  28.82 
 
 		 741 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  31.51 
 
 		 233 aa  113  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  32.11 
 
 		 233 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  32.11 
 
 		 233 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  28.94 
 
 		 750 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  31.65 
 
 		 233 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  28.05 
 
 		 539 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  29.38 
 
 		 756 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  27.24 
 
 		 730 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  28.82 
 
 		 734 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  27.85 
 
 		 524 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  29.68 
 
 		 721 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  38.02 
 
 		 211 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.28 
 
 		 482 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.46 
 
 		 234 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.79 
 
 		 215 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  32.46 
 
 		 232 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  30.07 
 
 		 711 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  28.42 
 
 		 763 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  26.53 
 
 		 806 aa  103  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  24.4 
 
 		 739 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  37.17 
 
 		 240 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  30.36 
 
 		 234 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  25.98 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3269  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.07 
 
 		 223 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.316861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  28.39 
 
 		 727 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  31.63 
 
 		 225 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  32.39 
 
 		 753 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  25.71 
 
 		 726 aa  100  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.71 
 
 		 726 aa  100  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  32.16 
 
 		 246 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.71 
 
 		 726 aa  100  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.71 
 
 		 726 aa  100  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.71 
 
 		 726 aa  100  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.71 
 
 		 726 aa  100  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  25.71 
 
 		 726 aa  100  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.71 
 
 		 726 aa  100  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  25.06 
 
 		 724 aa  99.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.08 
 
 		 225 aa  99.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  30.61 
 
 		 225 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  24.63 
 
 		 722 aa  99  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  30.1 
 
 		 257 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.39 
 
 		 235 aa  97.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  32.14 
 
 		 803 aa  96.7  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  28.52 
 
 		 727 aa  96.7  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  29.68 
 
 		 738 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2652  lipopolysaccharide biosynthesis  29.73 
 
 		 222 aa  96.3  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  28.57 
 
 		 225 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  26.56 
 
 		 743 aa  95.1  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  27.84 
 
 		 745 aa  94.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.76 
 
 		 227 aa  94  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  34.8 
 
 		 790 aa  94  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.27 
 
 		 247 aa  94  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  28.57 
 
 		 225 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  24.75 
 
 		 753 aa  94  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  29.49 
 
 		 247 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  24.57 
 
 		 753 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  28.01 
 
 		 731 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  29.57 
 
 		 733 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  33.17 
 
 		 754 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.56 
 
 		 247 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.72 
 
 		 724 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>