More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1003 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 		 477 aa  939    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  43.26 
 
 		 525 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  42.53 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  40.05 
 
 		 474 aa  280  5e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  39.81 
 
 		 503 aa  268  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  38.6 
 
 		 484 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  37.53 
 
 		 529 aa  256  6e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  40.52 
 
 		 492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  39.45 
 
 		 438 aa  254  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  36.51 
 
 		 509 aa  244  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  36.61 
 
 		 496 aa  243  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  37.61 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  35.03 
 
 		 508 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  34.95 
 
 		 505 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  37.03 
 
 		 453 aa  234  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  35.36 
 
 		 466 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  34.08 
 
 		 667 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  35.02 
 
 		 490 aa  230  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  34.06 
 
 		 615 aa  223  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  36.89 
 
 		 521 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  34.95 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  34.55 
 
 		 524 aa  211  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.1 
 
 		 454 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  35.95 
 
 		 473 aa  202  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  35.37 
 
 		 492 aa  197  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  36.12 
 
 		 443 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  31 
 
 		 492 aa  179  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  26.99 
 
 		 464 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.12 
 
 		 482 aa  172  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  34.8 
 
 		 730 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  32.99 
 
 		 755 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  34.75 
 
 		 790 aa  161  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  38.61 
 
 		 736 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  32.8 
 
 		 734 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  35.74 
 
 		 257 aa  156  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  35.02 
 
 		 804 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  35.69 
 
 		 722 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  31.43 
 
 		 815 aa  155  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  40.74 
 
 		 239 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  38.68 
 
 		 217 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  37.21 
 
 		 233 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  37.21 
 
 		 233 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  30.68 
 
 		 721 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  37.21 
 
 		 233 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  37.84 
 
 		 225 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 743 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  38.21 
 
 		 217 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  36.74 
 
 		 233 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  36.21 
 
 		 795 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  37.39 
 
 		 225 aa  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  34.04 
 
 		 750 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  34.71 
 
 		 742 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  36.28 
 
 		 233 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.21 
 
 		 234 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  29.02 
 
 		 726 aa  149  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  30.84 
 
 		 738 aa  149  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  33.77 
 
 		 783 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  35.22 
 
 		 775 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  40.09 
 
 		 795 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  39.35 
 
 		 233 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  37.39 
 
 		 225 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  37.9 
 
 		 232 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  32.54 
 
 		 741 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  30.61 
 
 		 815 aa  147  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 756 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.91 
 
 		 235 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.04 
 
 		 225 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  36.04 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  33.33 
 
 		 746 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  34.46 
 
 		 733 aa  144  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  28.71 
 
 		 731 aa  143  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  35.84 
 
 		 753 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  34.04 
 
 		 737 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  31.54 
 
 		 727 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  35.29 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  37.04 
 
 		 224 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  31.97 
 
 		 786 aa  139  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  37.67 
 
 		 803 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  35.56 
 
 		 802 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  30.77 
 
 		 756 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  31.5 
 
 		 527 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  30.65 
 
 		 745 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  31.84 
 
 		 798 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  33.21 
 
 		 806 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  33.59 
 
 		 766 aa  136  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.15 
 
 		 220 aa  136  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13861  hypothetical protein  28.25 
 
 		 780 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.832923  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.61 
 
 		 240 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  29.77 
 
 		 794 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  37.5 
 
 		 246 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  34.58 
 
 		 252 aa  135  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  34.32 
 
 		 735 aa  135  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  29.67 
 
 		 539 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  37.78 
 
 		 294 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  37.04 
 
 		 217 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  29.81 
 
 		 763 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  37.67 
 
 		 803 aa  134  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.02 
 
 		 228 aa  133  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.02 
 
 		 228 aa  133  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  30.12 
 
 		 759 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>