More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1906 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0519  capsular exopolysaccharide family  44.04 
 
 
819 aa  638    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 
795 aa  1619    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  55.57 
 
 
803 aa  827    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  55.27 
 
 
803 aa  820    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  46.25 
 
 
814 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350341  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0764  protein-tyrosine kinase  40.69 
 
 
763 aa  533  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0280941  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  25.56 
 
 
790 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 
804 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.55 
 
 
720 aa  197  9e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  27.25 
 
 
741 aa  190  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  24.06 
 
 
790 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.58 
 
 
806 aa  187  6e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  26.67 
 
 
753 aa  182  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.66 
 
 
734 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  29.52 
 
 
719 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  29.52 
 
 
719 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  27.19 
 
 
722 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  29.52 
 
 
719 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  29.52 
 
 
719 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  25.06 
 
 
779 aa  175  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  26.45 
 
 
742 aa  174  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  28.65 
 
 
719 aa  173  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  27.48 
 
 
774 aa  173  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  28.9 
 
 
720 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  28.9 
 
 
720 aa  171  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  29.14 
 
 
720 aa  171  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  28.9 
 
 
720 aa  171  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  28.9 
 
 
720 aa  171  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  28.71 
 
 
720 aa  171  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  24.58 
 
 
721 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  28.71 
 
 
720 aa  168  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  28.71 
 
 
720 aa  168  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 
730 aa  168  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  27.87 
 
 
720 aa  168  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  26.03 
 
 
756 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  25.21 
 
 
794 aa  165  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  25.34 
 
 
736 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  25.46 
 
 
727 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  23.95 
 
 
772 aa  161  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  27.19 
 
 
747 aa  158  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  30.86 
 
 
496 aa  156  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  24.05 
 
 
737 aa  155  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  29.65 
 
 
734 aa  156  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  23.26 
 
 
743 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  32.49 
 
 
730 aa  154  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  44.32 
 
 
246 aa  154  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  33.03 
 
 
503 aa  154  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  37.8 
 
 
667 aa  153  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  22.81 
 
 
795 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  25.03 
 
 
750 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  31.18 
 
 
723 aa  152  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  40.93 
 
 
252 aa  152  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.12 
 
 
736 aa  151  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  22.88 
 
 
802 aa  151  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  39.82 
 
 
766 aa  151  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  22.89 
 
 
783 aa  150  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  25.12 
 
 
775 aa  150  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  36 
 
 
615 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.4 
 
 
726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  24.4 
 
 
726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.4 
 
 
726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  24.4 
 
 
726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.4 
 
 
726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.4 
 
 
726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.4 
 
 
726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.4 
 
 
726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  25.84 
 
 
727 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  36.27 
 
 
217 aa  147  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.13 
 
 
731 aa  147  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  24.38 
 
 
786 aa  147  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  29.88 
 
 
802 aa  147  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  22.46 
 
 
738 aa  146  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  31.62 
 
 
723 aa  146  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.44 
 
 
741 aa  146  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.03 
 
 
225 aa  146  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.88 
 
 
217 aa  146  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  40.83 
 
 
454 aa  146  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  23.29 
 
 
820 aa  145  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  38.5 
 
 
225 aa  145  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  38.5 
 
 
225 aa  145  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  28.37 
 
 
739 aa  145  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.46 
 
 
234 aa  145  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  25.04 
 
 
763 aa  145  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  38.5 
 
 
225 aa  144  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  28.37 
 
 
739 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  37.56 
 
 
257 aa  144  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  40.93 
 
 
240 aa  144  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  37.61 
 
 
472 aa  144  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  38.5 
 
 
225 aa  144  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  29.97 
 
 
726 aa  144  8e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  28.14 
 
 
739 aa  144  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  23.9 
 
 
741 aa  144  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  37.98 
 
 
233 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  38.46 
 
 
233 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  38.46 
 
 
233 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  37.04 
 
 
233 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  38.46 
 
 
233 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  25.03 
 
 
746 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  27.91 
 
 
739 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  30.1 
 
 
745 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>