More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5247 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 		 509 aa  1006    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  44.01 
 
 		 667 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  44.2 
 
 		 615 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  42.83 
 
 		 454 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  42.6 
 
 		 505 aa  354  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  43.01 
 
 		 463 aa  351  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  41.19 
 
 		 466 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  46.67 
 
 		 473 aa  336  7e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  41.19 
 
 		 508 aa  330  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  41.56 
 
 		 472 aa  323  6e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  42.27 
 
 		 497 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  42.53 
 
 		 490 aa  319  7.999999999999999e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  42.18 
 
 		 525 aa  318  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  40.64 
 
 		 474 aa  318  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  41.19 
 
 		 484 aa  313  4.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  39.04 
 
 		 496 aa  313  5.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  38.91 
 
 		 503 aa  306  6e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  41.93 
 
 		 443 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  35.26 
 
 		 529 aa  267  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  35.36 
 
 		 521 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  34.83 
 
 		 524 aa  246  6.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  35.54 
 
 		 492 aa  243  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  37.21 
 
 		 438 aa  239  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  37.14 
 
 		 477 aa  237  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  31.78 
 
 		 464 aa  237  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  34.57 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  32.31 
 
 		 492 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  34.88 
 
 		 453 aa  201  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  37.12 
 
 		 790 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.19 
 
 		 482 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  34.26 
 
 		 804 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  36.3 
 
 		 741 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  37.29 
 
 		 741 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.29 
 
 		 741 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.3 
 
 		 741 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  37.29 
 
 		 741 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.96 
 
 		 741 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  36.3 
 
 		 741 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  31.09 
 
 		 539 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  34.12 
 
 		 742 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  35 
 
 		 739 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  29.31 
 
 		 734 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  35 
 
 		 739 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  35 
 
 		 739 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  32.38 
 
 		 730 aa  174  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.68 
 
 		 575 aa  173  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.44 
 
 		 217 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  35 
 
 		 739 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  34.52 
 
 		 740 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  40.48 
 
 		 232 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  38.97 
 
 		 217 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.26 
 
 		 730 aa  169  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  34.88 
 
 		 736 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  33.23 
 
 		 732 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  35.41 
 
 		 257 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  36.84 
 
 		 734 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  35.08 
 
 		 736 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  34.97 
 
 		 779 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  34.53 
 
 		 755 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  35.88 
 
 		 736 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  33.12 
 
 		 743 aa  163  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  39.53 
 
 		 225 aa  162  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  37.33 
 
 		 233 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  39.53 
 
 		 225 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  36.07 
 
 		 747 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  37.33 
 
 		 233 aa  160  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.07 
 
 		 720 aa  159  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  36.87 
 
 		 233 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  36.87 
 
 		 233 aa  159  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  36.41 
 
 		 233 aa  159  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  32.99 
 
 		 756 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.33 
 
 		 234 aa  158  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  27.74 
 
 		 624 aa  158  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 		 741 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  35.64 
 
 		 795 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  38.14 
 
 		 225 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  38.46 
 
 		 246 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  31.15 
 
 		 755 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  31.43 
 
 		 784 aa  157  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  30.91 
 
 		 722 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  36.63 
 
 		 741 aa  156  7e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  39.25 
 
 		 802 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  31.96 
 
 		 746 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  32.5 
 
 		 721 aa  156  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.5 
 
 		 235 aa  156  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  32.48 
 
 		 748 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  32.36 
 
 		 764 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  31.58 
 
 		 726 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.72 
 
 		 230 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.72 
 
 		 230 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  32.89 
 
 		 751 aa  154  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  34.14 
 
 		 746 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  34.14 
 
 		 746 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  34.14 
 
 		 746 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  31.79 
 
 		 726 aa  153  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  31.79 
 
 		 726 aa  153  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  31.79 
 
 		 726 aa  153  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  31.79 
 
 		 726 aa  153  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  31.79 
 
 		 726 aa  153  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  31.79 
 
 		 726 aa  153  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>