More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0465 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 217 aa  443  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  98.16 
 
 		 217 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  50.24 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  49.04 
 
 		 232 aa  205  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  44.13 
 
 		 225 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  47 
 
 		 464 aa  197  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  43.58 
 
 		 454 aa  197  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  44.13 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  51.47 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  46.04 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  44.13 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  43.66 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  47.64 
 
 		 492 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  43.66 
 
 		 257 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  42.72 
 
 		 233 aa  194  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  43.19 
 
 		 233 aa  194  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  42.72 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  43.19 
 
 		 233 aa  194  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  44.34 
 
 		 215 aa  193  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  43.19 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  42.72 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  42.01 
 
 		 472 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  42.25 
 
 		 225 aa  188  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  42.86 
 
 		 575 aa  188  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  46.01 
 
 		 233 aa  184  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  43.78 
 
 		 240 aa  184  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  46.84 
 
 		 205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  46.01 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  45.02 
 
 		 730 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  41.58 
 
 		 496 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  42.59 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  38.74 
 
 		 615 aa  178  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  42.71 
 
 		 474 aa  176  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  43.65 
 
 		 466 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  41.59 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  42.29 
 
 		 790 aa  175  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  39.64 
 
 		 667 aa  174  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  42.11 
 
 		 505 aa  174  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  40.65 
 
 		 722 aa  174  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  43.48 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  40.8 
 
 		 509 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  43.68 
 
 		 508 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  39.53 
 
 		 463 aa  171  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3000  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  46.27 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  41.58 
 
 		 497 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  41.8 
 
 		 443 aa  167  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  41.43 
 
 		 803 aa  167  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  41.58 
 
 		 734 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  42.36 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  41.23 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  42.31 
 
 		 524 aa  165  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.91 
 
 		 230 aa  165  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.91 
 
 		 230 aa  165  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  39.72 
 
 		 741 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  41.15 
 
 		 804 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  44.44 
 
 		 492 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  38.73 
 
 		 257 aa  159  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  38.74 
 
 		 503 aa  158  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  38.14 
 
 		 742 aa  158  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.74 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.74 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  39.38 
 
 		 803 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  42.79 
 
 		 525 aa  156  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  39.32 
 
 		 721 aa  155  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  40 
 
 		 624 aa  155  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  41.33 
 
 		 774 aa  155  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  37.13 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  37.62 
 
 		 763 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  37.14 
 
 		 743 aa  154  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  38.24 
 
 		 521 aa  153  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  41.18 
 
 		 741 aa  153  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  40 
 
 		 605 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  38.81 
 
 		 453 aa  153  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  40.5 
 
 		 484 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  38.62 
 
 		 490 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  37.31 
 
 		 585 aa  152  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2153  capsular exopolysaccharide family  38.46 
 
 		 713 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  38.92 
 
 		 753 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  42.29 
 
 		 779 aa  152  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  34.84 
 
 		 766 aa  150  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  36.24 
 
 		 745 aa  150  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  41.67 
 
 		 772 aa  149  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.65 
 
 		 736 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  40.69 
 
 		 795 aa  148  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  37.75 
 
 		 529 aa  149  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  45.13 
 
 		 756 aa  148  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  37.93 
 
 		 739 aa  148  8e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  42.41 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  36.36 
 
 		 736 aa  145  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  34.88 
 
 		 795 aa  145  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2447  capsular exopolysaccharide family  39.32 
 
 		 278 aa  145  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.13568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.32 
 
 		 800 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1420  capsular exopolysaccharide family  33.65 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  39.2 
 
 		 492 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  41 
 
 		 722 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  40.11 
 
 		 786 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  38.27 
 
 		 739 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  38.27 
 
 		 739 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  38.27 
 
 		 739 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40 
 
 		 482 aa  142  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>