More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3804 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  100 
 
 
774 aa  1565    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  32.04 
 
 
743 aa  365  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  33.07 
 
 
711 aa  360  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  32.17 
 
 
756 aa  343  8e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  28.16 
 
 
730 aa  279  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  28.36 
 
 
753 aa  264  4.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  26.32 
 
 
745 aa  263  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  26.6 
 
 
721 aa  256  8e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  25.63 
 
 
737 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 
737 aa  246  9e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.43 
 
 
731 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  28.74 
 
 
756 aa  245  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  26.54 
 
 
755 aa  236  9e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  29.5 
 
 
734 aa  230  6e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  26.42 
 
 
772 aa  229  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  27.5 
 
 
779 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  27.3 
 
 
770 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  26.1 
 
 
726 aa  224  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  25.75 
 
 
797 aa  222  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  26.44 
 
 
756 aa  219  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 
738 aa  208  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  28.77 
 
 
804 aa  208  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  26.9 
 
 
733 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.62 
 
 
738 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  25.73 
 
 
803 aa  193  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.55 
 
 
734 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  24.49 
 
 
727 aa  190  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  26.77 
 
 
766 aa  190  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 
745 aa  189  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  37.92 
 
 
464 aa  187  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  23.54 
 
 
741 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  27.05 
 
 
795 aa  183  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.72 
 
 
720 aa  183  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  26.43 
 
 
790 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.2 
 
 
739 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  34.25 
 
 
667 aa  178  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  26.67 
 
 
742 aa  178  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  24.97 
 
 
750 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  34.4 
 
 
615 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  28 
 
 
763 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  24.26 
 
 
803 aa  176  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  25.83 
 
 
806 aa  174  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.44 
 
 
720 aa  174  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  26.76 
 
 
741 aa  173  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  24.32 
 
 
739 aa  173  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  36.53 
 
 
496 aa  172  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  47.92 
 
 
235 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  33.33 
 
 
736 aa  171  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  32.23 
 
 
524 aa  168  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  35.6 
 
 
454 aa  167  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  36.07 
 
 
529 aa  166  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.6 
 
 
575 aa  164  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  27 
 
 
527 aa  164  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  34.62 
 
 
492 aa  164  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  24.87 
 
 
750 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  25.76 
 
 
753 aa  162  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  36.52 
 
 
505 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  26.69 
 
 
722 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  35.09 
 
 
521 aa  160  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  41.06 
 
 
217 aa  159  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  36.81 
 
 
463 aa  158  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.56 
 
 
722 aa  157  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  24.08 
 
 
815 aa  157  8e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0519  capsular exopolysaccharide family  25.53 
 
 
819 aa  157  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.06 
 
 
724 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  28.86 
 
 
746 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  23.92 
 
 
814 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350341  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  35.4 
 
 
472 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  22.5 
 
 
872 aa  154  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  40.19 
 
 
217 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  39.04 
 
 
225 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  27.82 
 
 
684 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  25.62 
 
 
795 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2153  capsular exopolysaccharide family  25.24 
 
 
713 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428306  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  43.01 
 
 
232 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.35 
 
 
779 aa  152  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.04 
 
 
482 aa  152  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  24.9 
 
 
710 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  24.08 
 
 
772 aa  150  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.58 
 
 
225 aa  151  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.37 
 
 
739 aa  150  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  34.36 
 
 
508 aa  150  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  28.25 
 
 
747 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  23.92 
 
 
739 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  38.1 
 
 
217 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  24.23 
 
 
741 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  42.29 
 
 
257 aa  149  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.41 
 
 
750 aa  149  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  24.58 
 
 
739 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  39.38 
 
 
252 aa  148  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  37.28 
 
 
225 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  37.28 
 
 
225 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  38.6 
 
 
233 aa  147  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  36.84 
 
 
257 aa  147  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  41.13 
 
 
239 aa  147  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  34.16 
 
 
503 aa  147  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  39.32 
 
 
225 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  28.35 
 
 
739 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  25.66 
 
 
727 aa  145  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  24.97 
 
 
753 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>