More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6307 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 
772 aa  1572    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  43.46 
 
 
795 aa  579  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  40.91 
 
 
775 aa  568  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  38.54 
 
 
783 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  37.09 
 
 
767 aa  489  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  36.79 
 
 
794 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  33.11 
 
 
798 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  34.36 
 
 
759 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  32.35 
 
 
796 aa  404  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  32.89 
 
 
784 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  29.72 
 
 
753 aa  355  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  30.38 
 
 
786 aa  325  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  28.89 
 
 
822 aa  315  1.9999999999999998e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  25.52 
 
 
802 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  27.52 
 
 
815 aa  261  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  26.94 
 
 
800 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  25.74 
 
 
815 aa  253  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2664  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.69 
 
 
345 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933952  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  23.95 
 
 
790 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 
804 aa  206  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2078  capsular exopolysaccharide family  25.26 
 
 
800 aa  205  3e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.325756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  24.01 
 
 
727 aa  203  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  23.77 
 
 
820 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  23.77 
 
 
806 aa  196  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  25.5 
 
 
723 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  23.92 
 
 
746 aa  183  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  24.68 
 
 
744 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  23.47 
 
 
716 aa  178  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  23.8 
 
 
744 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  22 
 
 
726 aa  174  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  23.54 
 
 
741 aa  173  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  23.86 
 
 
751 aa  172  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  22.08 
 
 
740 aa  171  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.83 
 
 
741 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  21.49 
 
 
734 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  21.72 
 
 
731 aa  167  9e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  23.72 
 
 
732 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  20.92 
 
 
736 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  22.38 
 
 
767 aa  165  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  24.91 
 
 
735 aa  164  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.72 
 
 
730 aa  164  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  22.43 
 
 
721 aa  162  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  25 
 
 
753 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  22.41 
 
 
733 aa  158  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  22.48 
 
 
724 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  21.46 
 
 
720 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  21.59 
 
 
720 aa  157  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  21.46 
 
 
720 aa  157  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  21.46 
 
 
720 aa  157  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  21.46 
 
 
720 aa  156  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  23.8 
 
 
747 aa  156  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  23.07 
 
 
740 aa  156  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  21.46 
 
 
720 aa  156  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  21.33 
 
 
720 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  25.17 
 
 
743 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  21.33 
 
 
720 aa  155  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.21 
 
 
779 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  22.38 
 
 
757 aa  154  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  22.26 
 
 
784 aa  154  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  23.42 
 
 
723 aa  154  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.85 
 
 
741 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  23.33 
 
 
747 aa  153  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  26.85 
 
 
741 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  26.85 
 
 
741 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.91 
 
 
726 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.91 
 
 
726 aa  152  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  22.91 
 
 
726 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.91 
 
 
726 aa  152  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.91 
 
 
726 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  22.91 
 
 
726 aa  152  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  22.7 
 
 
753 aa  152  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  26.35 
 
 
741 aa  152  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.91 
 
 
726 aa  152  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  20.93 
 
 
736 aa  151  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.91 
 
 
726 aa  151  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  26.11 
 
 
741 aa  151  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.11 
 
 
741 aa  150  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  23.28 
 
 
759 aa  148  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  23.07 
 
 
746 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.17 
 
 
736 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.28 
 
 
720 aa  147  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  35.6 
 
 
505 aa  147  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  22.93 
 
 
746 aa  147  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  22.93 
 
 
746 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  22.78 
 
 
746 aa  145  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  20.75 
 
 
745 aa  144  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  24.49 
 
 
750 aa  143  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  22.74 
 
 
744 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  25.53 
 
 
720 aa  141  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  23.73 
 
 
747 aa  140  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  25.79 
 
 
719 aa  140  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.04 
 
 
730 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  25.53 
 
 
719 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  26.27 
 
 
739 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  26.27 
 
 
739 aa  139  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  22.18 
 
 
748 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  27.16 
 
 
724 aa  139  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  25.53 
 
 
719 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  26.27 
 
 
739 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  25.53 
 
 
719 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>