More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2286 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 
784 aa  1607    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  32.38 
 
 
775 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  33.16 
 
 
783 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  31.97 
 
 
794 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  32.68 
 
 
772 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  33.11 
 
 
795 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  32.1 
 
 
798 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  30.8 
 
 
767 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  28.8 
 
 
759 aa  319  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  27.61 
 
 
796 aa  304  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  27.44 
 
 
753 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  28.4 
 
 
786 aa  283  7.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  28.48 
 
 
802 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  27.66 
 
 
822 aa  272  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  29.94 
 
 
815 aa  256  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  25.12 
 
 
800 aa  239  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  23.36 
 
 
815 aa  226  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2078  capsular exopolysaccharide family  26.98 
 
 
800 aa  214  2.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.325756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  23.62 
 
 
767 aa  203  8e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  23.93 
 
 
820 aa  189  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 
804 aa  181  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  22.75 
 
 
806 aa  171  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  21.87 
 
 
790 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  24.02 
 
 
734 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  28.33 
 
 
745 aa  161  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  24.7 
 
 
750 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.87 
 
 
741 aa  158  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.59 
 
 
741 aa  157  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  27.59 
 
 
741 aa  157  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  27.59 
 
 
741 aa  157  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  27.01 
 
 
741 aa  157  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.3 
 
 
741 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  22.52 
 
 
748 aa  156  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  27.3 
 
 
741 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  28.65 
 
 
732 aa  154  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  27.53 
 
 
740 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.28 
 
 
720 aa  154  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  25.04 
 
 
740 aa  153  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.93 
 
 
736 aa  153  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.97 
 
 
730 aa  153  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  23.29 
 
 
747 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.89 
 
 
755 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  22.12 
 
 
744 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  25.55 
 
 
756 aa  149  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  24.75 
 
 
740 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  30.79 
 
 
492 aa  147  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 
737 aa  147  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  25.94 
 
 
739 aa  146  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  26.93 
 
 
739 aa  145  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  26.65 
 
 
739 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  26.65 
 
 
739 aa  144  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  27.95 
 
 
745 aa  144  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  28.34 
 
 
720 aa  144  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  28.19 
 
 
759 aa  144  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  29.7 
 
 
667 aa  144  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  28.34 
 
 
720 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  28.34 
 
 
720 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  28.34 
 
 
720 aa  143  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  28.34 
 
 
720 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  29.85 
 
 
496 aa  143  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  28.34 
 
 
720 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  28.07 
 
 
720 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  30.49 
 
 
521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  28.07 
 
 
720 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  27.79 
 
 
719 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 
738 aa  141  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  30.4 
 
 
740 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  26.35 
 
 
741 aa  141  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  27.79 
 
 
719 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  27.79 
 
 
719 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  27.79 
 
 
719 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  26.44 
 
 
751 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  24.56 
 
 
720 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  27.52 
 
 
719 aa  139  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  23.01 
 
 
723 aa  137  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  22.97 
 
 
746 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  22.25 
 
 
734 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0251  non-specific protein-tyrosine kinase  21.97 
 
 
751 aa  137  8e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  26.4 
 
 
730 aa  137  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  21.45 
 
 
736 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.25 
 
 
726 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  27.96 
 
 
741 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  26.61 
 
 
746 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  23.49 
 
 
734 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  23.31 
 
 
727 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  24.74 
 
 
753 aa  135  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  27.09 
 
 
746 aa  135  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  21.54 
 
 
726 aa  135  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  26.42 
 
 
747 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  26.79 
 
 
753 aa  134  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  29.58 
 
 
472 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.93 
 
 
217 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  34.93 
 
 
217 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  33.05 
 
 
484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.82 
 
 
575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  29.89 
 
 
464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  22.15 
 
 
736 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  24.25 
 
 
738 aa  132  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  28.76 
 
 
454 aa  131  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  29.89 
 
 
508 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>