More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0436 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  100 
 
 
822 aa  1675    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  33.69 
 
 
796 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  31.07 
 
 
783 aa  357  5e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  30.42 
 
 
775 aa  344  4e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  30.13 
 
 
759 aa  343  9e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  28.35 
 
 
798 aa  330  7e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  29.86 
 
 
795 aa  325  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  29.17 
 
 
772 aa  324  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  29.2 
 
 
767 aa  320  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2078  capsular exopolysaccharide family  29.43 
 
 
800 aa  314  3.9999999999999997e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.325756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  27.8 
 
 
794 aa  310  5e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  28.74 
 
 
753 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  28.44 
 
 
786 aa  280  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  27.66 
 
 
784 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  28.75 
 
 
815 aa  264  6e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  27.03 
 
 
815 aa  220  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  24.08 
 
 
802 aa  202  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  25.71 
 
 
747 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.57 
 
 
806 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  25.03 
 
 
746 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  24.5 
 
 
745 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  24.31 
 
 
800 aa  188  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 
804 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  22.56 
 
 
790 aa  177  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  21.8 
 
 
726 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  23.16 
 
 
719 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  23.18 
 
 
734 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  24.27 
 
 
746 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  22.93 
 
 
721 aa  172  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  21.74 
 
 
741 aa  172  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  22.28 
 
 
730 aa  171  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.11 
 
 
741 aa  169  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  23.61 
 
 
740 aa  169  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  23.84 
 
 
716 aa  169  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  23.99 
 
 
724 aa  167  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  23.05 
 
 
820 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.44 
 
 
741 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  29.11 
 
 
739 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  22.99 
 
 
739 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.46 
 
 
730 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  29.47 
 
 
739 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  29.47 
 
 
739 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  29.44 
 
 
741 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  22.84 
 
 
723 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  23.34 
 
 
734 aa  165  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.18 
 
 
741 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  28.65 
 
 
741 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  29.18 
 
 
741 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  29.18 
 
 
741 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  24.84 
 
 
749 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  21.79 
 
 
740 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  24.57 
 
 
732 aa  162  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  22.17 
 
 
744 aa  160  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  22.26 
 
 
744 aa  160  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  23.63 
 
 
735 aa  158  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  21.12 
 
 
722 aa  157  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  28.22 
 
 
727 aa  156  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  22.29 
 
 
802 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  21.38 
 
 
736 aa  153  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  24.11 
 
 
746 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  28.68 
 
 
719 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.64 
 
 
720 aa  152  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  25.79 
 
 
722 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  28.46 
 
 
719 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  28.42 
 
 
719 aa  150  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  28.42 
 
 
719 aa  150  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  22.04 
 
 
753 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  29.71 
 
 
733 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.34 
 
 
755 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.9 
 
 
736 aa  149  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  23.97 
 
 
741 aa  148  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.61 
 
 
730 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  28.53 
 
 
724 aa  146  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  27.63 
 
 
720 aa  146  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  26.2 
 
 
736 aa  147  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0251  non-specific protein-tyrosine kinase  24.07 
 
 
751 aa  145  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  23.85 
 
 
743 aa  144  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  27.79 
 
 
720 aa  144  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  22.86 
 
 
759 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  23.29 
 
 
767 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  27.79 
 
 
720 aa  142  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  27.53 
 
 
720 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  27.53 
 
 
720 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  27.53 
 
 
720 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  27.53 
 
 
720 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  27.53 
 
 
720 aa  141  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  27.53 
 
 
720 aa  141  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 
761 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4101  hypothetical protein  26.78 
 
 
722 aa  141  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.965422  normal  0.2163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  24.14 
 
 
734 aa  140  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  22.43 
 
 
723 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  23.22 
 
 
747 aa  140  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0611  protein-tyrosine kinase  23.54 
 
 
753 aa  139  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  21.53 
 
 
748 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  24.01 
 
 
751 aa  137  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  25.51 
 
 
750 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  34.68 
 
 
454 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  22.71 
 
 
746 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  22.71 
 
 
746 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  30.91 
 
 
464 aa  135  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>