More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3362 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 		 753 aa  1540    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  33.15 
 
 		 798 aa  435  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  30.86 
 
 		 795 aa  362  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  30.61 
 
 		 783 aa  358  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  29.72 
 
 		 772 aa  355  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  30.81 
 
 		 794 aa  346  7e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  30.05 
 
 		 775 aa  335  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  29.09 
 
 		 796 aa  335  3e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  28.53 
 
 		 759 aa  328  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  30.01 
 
 		 767 aa  303  6.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  28.73 
 
 		 822 aa  303  1e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  27.35 
 
 		 784 aa  280  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  28.38 
 
 		 786 aa  277  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2078  capsular exopolysaccharide family  27.05 
 
 		 800 aa  221  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.325756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  24.65 
 
 		 815 aa  214  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  24.77 
 
 		 815 aa  213  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  24.19 
 
 		 802 aa  203  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  24.64 
 
 		 800 aa  201  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  26.17 
 
 		 790 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 804 aa  187  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  24.32 
 
 		 735 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  24.87 
 
 		 753 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  22.69 
 
 		 748 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  22.51 
 
 		 806 aa  171  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  22.53 
 
 		 747 aa  169  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  22.5 
 
 		 767 aa  169  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  24.23 
 
 		 755 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  22.76 
 
 		 720 aa  165  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  22.58 
 
 		 720 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  23.13 
 
 		 719 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  22.58 
 
 		 720 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  22.63 
 
 		 720 aa  164  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  22.5 
 
 		 720 aa  164  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  22.92 
 
 		 719 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  22.87 
 
 		 719 aa  164  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  23.02 
 
 		 719 aa  164  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  22.63 
 
 		 720 aa  164  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  22.15 
 
 		 720 aa  163  9e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  22.61 
 
 		 720 aa  163  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  22.63 
 
 		 720 aa  163  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  22.87 
 
 		 719 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  23.47 
 
 		 723 aa  162  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  22.1 
 
 		 724 aa  158  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  23.73 
 
 		 723 aa  157  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  22.95 
 
 		 753 aa  155  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.54 
 
 		 726 aa  154  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  23.05 
 
 		 747 aa  151  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  22.5 
 
 		 820 aa  150  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  21.44 
 
 		 741 aa  146  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  22.38 
 
 		 734 aa  145  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  23.82 
 
 		 746 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  23.21 
 
 		 740 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  23.82 
 
 		 746 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  26.47 
 
 		 750 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  24.61 
 
 		 746 aa  144  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  23.82 
 
 		 746 aa  144  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  22.55 
 
 		 746 aa  144  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  24.38 
 
 		 745 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  22.61 
 
 		 751 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0611  protein-tyrosine kinase  21.65 
 
 		 753 aa  140  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  23.67 
 
 		 740 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3622  hypothetical protein  23.5 
 
 		 760 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  22.81 
 
 		 740 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  23.48 
 
 		 747 aa  135  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2664  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.78 
 
 		 345 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933952  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4097  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.52 
 
 		 760 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  21.45 
 
 		 726 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  23.34 
 
 		 734 aa  133  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  27.1 
 
 		 753 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  20.76 
 
 		 721 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  23.52 
 
 		 733 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.61 
 
 		 720 aa  131  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  20.49 
 
 		 744 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  31.11 
 
 		 496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  23.91 
 
 		 722 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  21.69 
 
 		 716 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  22.74 
 
 		 759 aa  129  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  22.85 
 
 		 744 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  25.33 
 
 		 727 aa  128  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.68 
 
 		 736 aa  129  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  23.86 
 
 		 756 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  22.45 
 
 		 731 aa  127  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0764  protein-tyrosine kinase  22.48 
 
 		 763 aa  126  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0280941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  24.44 
 
 		 741 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  23.17 
 
 		 746 aa  126  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  23.47 
 
 		 745 aa  125  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  23.33 
 
 		 745 aa  124  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  23.08 
 
 		 770 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  23.1 
 
 		 750 aa  123  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.76 
 
 		 741 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  22.86 
 
 		 757 aa  122  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2866  exopolysaccharide transporter  24.2 
 
 		 764 aa  122  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  22.04 
 
 		 726 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  26.53 
 
 		 722 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.04 
 
 		 726 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.04 
 
 		 726 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  22.04 
 
 		 726 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.04 
 
 		 726 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.04 
 
 		 726 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.04 
 
 		 726 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>