More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2078 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_2078  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 		 800 aa  1640    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.325756 
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  29.54 
 
 		 822 aa  330  8e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  28.13 
 
 		 796 aa  308  4.0000000000000004e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  28.36 
 
 		 795 aa  270  8e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  27.34 
 
 		 775 aa  269  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  27.18 
 
 		 783 aa  268  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  24.97 
 
 		 798 aa  254  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  26.98 
 
 		 759 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  25.98 
 
 		 794 aa  248  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  26.73 
 
 		 767 aa  247  6.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  27.02 
 
 		 753 aa  242  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  25.35 
 
 		 772 aa  234  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  26.41 
 
 		 784 aa  227  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  23.72 
 
 		 786 aa  193  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  24.41 
 
 		 802 aa  192  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  24.77 
 
 		 815 aa  192  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  25.88 
 
 		 790 aa  181  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  25.73 
 
 		 806 aa  170  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  23.21 
 
 		 815 aa  160  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  24.84 
 
 		 727 aa  156  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.81 
 
 		 720 aa  148  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  23.49 
 
 		 726 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 804 aa  145  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.61 
 
 		 734 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  25.06 
 
 		 745 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  25.93 
 
 		 730 aa  140  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  25.09 
 
 		 820 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  25.05 
 
 		 800 aa  139  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  25.43 
 
 		 745 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  25.11 
 
 		 740 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.56 
 
 		 743 aa  138  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  29.92 
 
 		 739 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  29.92 
 
 		 739 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  29.92 
 
 		 739 aa  137  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.83 
 
 		 726 aa  135  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  24.75 
 
 		 740 aa  134  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  25.71 
 
 		 746 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  25.55 
 
 		 745 aa  133  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  23.08 
 
 		 740 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25.5 
 
 		 756 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  29.38 
 
 		 739 aa  132  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  26.5 
 
 		 721 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  25.5 
 
 		 753 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  23.39 
 
 		 746 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  23.47 
 
 		 737 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  27.68 
 
 		 527 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  31.17 
 
 		 454 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  25.18 
 
 		 733 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  24.61 
 
 		 746 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  24.61 
 
 		 746 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.7 
 
 		 730 aa  128  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  24.45 
 
 		 746 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  25.21 
 
 		 759 aa  127  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 737 aa  127  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  28.31 
 
 		 751 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  24.74 
 
 		 784 aa  127  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  28.27 
 
 		 735 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  23.95 
 
 		 747 aa  126  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  23.76 
 
 		 721 aa  126  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  22.63 
 
 		 732 aa  126  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  29.59 
 
 		 624 aa  126  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  24.6 
 
 		 745 aa  125  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  28.68 
 
 		 720 aa  125  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  27.9 
 
 		 721 aa  125  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.92 
 
 		 463 aa  125  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  25.37 
 
 		 746 aa  124  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  28.42 
 
 		 720 aa  124  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  28.42 
 
 		 720 aa  124  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  27.82 
 
 		 753 aa  124  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  28.42 
 
 		 720 aa  124  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  24.56 
 
 		 747 aa  124  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  28.05 
 
 		 753 aa  124  9e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  28.42 
 
 		 720 aa  124  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  21.71 
 
 		 802 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  28.12 
 
 		 734 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  28.17 
 
 		 720 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  25.17 
 
 		 756 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  28.17 
 
 		 720 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  28.17 
 
 		 720 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  23.89 
 
 		 722 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  25.68 
 
 		 716 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  22.88 
 
 		 736 aa  122  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  30.74 
 
 		 605 aa  122  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  29.14 
 
 		 496 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  24.68 
 
 		 741 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  29 
 
 		 731 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  24.12 
 
 		 730 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  28.21 
 
 		 720 aa  121  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.92 
 
 		 738 aa  121  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  28.12 
 
 		 749 aa  121  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.51 
 
 		 739 aa  121  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  30.59 
 
 		 667 aa  120  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  23.76 
 
 		 723 aa  120  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  27.42 
 
 		 740 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  22.27 
 
 		 767 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  23.11 
 
 		 741 aa  119  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.23 
 
 		 739 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  27.71 
 
 		 719 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0611  protein-tyrosine kinase  27.66 
 
 		 753 aa  118  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  27.54 
 
 		 741 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>