More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0846 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  100 
 
 		 800 aa  1633    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  34.75 
 
 		 786 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  30.13 
 
 		 815 aa  327  5e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  28.34 
 
 		 795 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  28.8 
 
 		 775 aa  297  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  26.52 
 
 		 798 aa  296  9e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  27.03 
 
 		 815 aa  281  3e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  27.19 
 
 		 783 aa  277  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  26.76 
 
 		 802 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  26.94 
 
 		 772 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  26.08 
 
 		 794 aa  266  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  27.55 
 
 		 796 aa  263  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  26.4 
 
 		 767 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  24.81 
 
 		 784 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  25.59 
 
 		 759 aa  229  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  24.64 
 
 		 753 aa  213  9e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  24.77 
 
 		 822 aa  199  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  22.33 
 
 		 790 aa  173  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.09 
 
 		 804 aa  172  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  23.71 
 
 		 767 aa  162  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  23.76 
 
 		 806 aa  150  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  24.65 
 
 		 727 aa  150  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  23.39 
 
 		 820 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  23.34 
 
 		 723 aa  142  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  22.17 
 
 		 723 aa  140  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  22.11 
 
 		 733 aa  140  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  21.3 
 
 		 720 aa  138  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  21.85 
 
 		 736 aa  138  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  22.47 
 
 		 716 aa  138  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  25.22 
 
 		 739 aa  137  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  22.14 
 
 		 730 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  23.26 
 
 		 720 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  25 
 
 		 755 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  23.26 
 
 		 720 aa  134  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  22.78 
 
 		 720 aa  134  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  22.78 
 
 		 720 aa  134  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  22.78 
 
 		 720 aa  134  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  22.78 
 
 		 720 aa  134  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  22.78 
 
 		 720 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  22.66 
 
 		 720 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  20.75 
 
 		 736 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  30.96 
 
 		 454 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  21.67 
 
 		 724 aa  132  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  20.13 
 
 		 726 aa  131  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  21.33 
 
 		 734 aa  130  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0611  protein-tyrosine kinase  23.17 
 
 		 753 aa  130  9.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  21.79 
 
 		 719 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  23.56 
 
 		 740 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  21.17 
 
 		 730 aa  128  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  25.07 
 
 		 740 aa  128  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  21.66 
 
 		 719 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  32 
 
 		 496 aa  127  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  22.83 
 
 		 732 aa  127  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.42 
 
 		 720 aa  127  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  21.66 
 
 		 719 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  21.66 
 
 		 719 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  22.18 
 
 		 750 aa  127  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  20.52 
 
 		 747 aa  126  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  21.77 
 
 		 795 aa  124  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  22.18 
 
 		 739 aa  124  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  27.23 
 
 		 731 aa  123  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  22.92 
 
 		 721 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.98 
 
 		 482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4101  hypothetical protein  21.04 
 
 		 722 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.965422  normal  0.2163 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.13 
 
 		 736 aa  122  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  30.91 
 
 		 667 aa  122  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2078  capsular exopolysaccharide family  24.03 
 
 		 800 aa  122  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.325756 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  20.47 
 
 		 746 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  21.81 
 
 		 739 aa  121  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  27.48 
 
 		 753 aa  120  7e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.58 
 
 		 228 aa  120  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.58 
 
 		 228 aa  120  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  21.96 
 
 		 735 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  20.32 
 
 		 745 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25 
 
 		 730 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  21.81 
 
 		 739 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  28.02 
 
 		 739 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  31.9 
 
 		 503 aa  119  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 738 aa  118  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  21.14 
 
 		 753 aa  118  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  29.64 
 
 		 743 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  21.54 
 
 		 719 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.2 
 
 		 741 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.61 
 
 		 217 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  35.61 
 
 		 217 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  35.23 
 
 		 257 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  35.23 
 
 		 225 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.8 
 
 		 726 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  35.75 
 
 		 225 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  22.34 
 
 		 736 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  21.22 
 
 		 747 aa  115  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  33.17 
 
 		 225 aa  114  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  25.67 
 
 		 746 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  26.49 
 
 		 741 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  25 
 
 		 745 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  26.34 
 
 		 759 aa  113  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  28.31 
 
 		 747 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  32.44 
 
 		 484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  30.22 
 
 		 472 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.49 
 
 		 741 aa  112  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>