More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2885 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  100 
 
 		 767 aa  1546    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  24.49 
 
 		 798 aa  225  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  24.85 
 
 		 786 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  24.03 
 
 		 802 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  23.93 
 
 		 784 aa  204  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  23.6 
 
 		 767 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  21.21 
 
 		 775 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  23.19 
 
 		 783 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  24.17 
 
 		 794 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  22.71 
 
 		 759 aa  173  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  21.82 
 
 		 795 aa  171  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  22.5 
 
 		 753 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  22.38 
 
 		 772 aa  165  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  23.01 
 
 		 800 aa  155  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 804 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  23.64 
 
 		 815 aa  149  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  23.39 
 
 		 822 aa  142  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  22.9 
 
 		 796 aa  142  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  21.92 
 
 		 790 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  25.64 
 
 		 815 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  23.65 
 
 		 820 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  22.51 
 
 		 806 aa  127  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  18.82 
 
 		 736 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  18.58 
 
 		 736 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  21 
 
 		 759 aa  115  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  22 
 
 		 738 aa  114  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  19.31 
 
 		 726 aa  114  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  22.9 
 
 		 711 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  22.62 
 
 		 743 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  22.14 
 
 		 750 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2078  capsular exopolysaccharide family  22.27 
 
 		 800 aa  110  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.325756 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  19.84 
 
 		 746 aa  109  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  20.53 
 
 		 749 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  21.37 
 
 		 734 aa  107  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  22.74 
 
 		 779 aa  106  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  19.25 
 
 		 739 aa  106  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.27 
 
 		 720 aa  105  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  23 
 
 		 756 aa  105  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  23.41 
 
 		 727 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  19.11 
 
 		 739 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  18.23 
 
 		 740 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  21.84 
 
 		 726 aa  103  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 730 aa  103  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  20.5 
 
 		 739 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  20.05 
 
 		 746 aa  103  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  21.5 
 
 		 750 aa  101  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  19.92 
 
 		 746 aa  102  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  23.02 
 
 		 738 aa  101  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  19.92 
 
 		 746 aa  101  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  19.33 
 
 		 755 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  23.76 
 
 		 527 aa  99.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  19.89 
 
 		 739 aa  98.2  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4097  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.46 
 
 		 760 aa  98.6  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  19.41 
 
 		 734 aa  98.6  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  21.6 
 
 		 872 aa  97.4  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  19.1 
 
 		 726 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  19.1 
 
 		 726 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  19.1 
 
 		 726 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  21.14 
 
 		 755 aa  97.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  19.1 
 
 		 726 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  19.1 
 
 		 726 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  19.1 
 
 		 726 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  20.31 
 
 		 764 aa  97.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  19.1 
 
 		 726 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  19.39 
 
 		 740 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  21.42 
 
 		 731 aa  96.3  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3622  hypothetical protein  20.27 
 
 		 760 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  19.96 
 
 		 780 aa  95.9  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.49 
 
 		 741 aa  95.5  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.66 
 
 		 741 aa  95.9  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  22.49 
 
 		 741 aa  95.5  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  19.1 
 
 		 726 aa  95.9  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  22.49 
 
 		 741 aa  95.5  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  20.83 
 
 		 737 aa  94.7  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  19.74 
 
 		 750 aa  94.7  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  18.17 
 
 		 747 aa  95.1  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  21.6 
 
 		 741 aa  94.7  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.6 
 
 		 741 aa  94.7  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  21.96 
 
 		 741 aa  94.4  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  19.01 
 
 		 734 aa  94.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  20.42 
 
 		 747 aa  94  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  22.72 
 
 		 803 aa  93.2  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  19.46 
 
 		 784 aa  94  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  20.44 
 
 		 720 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  20.44 
 
 		 720 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  20.16 
 
 		 720 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  20.16 
 
 		 720 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  19.18 
 
 		 741 aa  93.2  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  20.44 
 
 		 720 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  21.13 
 
 		 756 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  20.44 
 
 		 720 aa  92  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  20.46 
 
 		 723 aa  92.4  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  20.32 
 
 		 784 aa  92  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  21.56 
 
 		 748 aa  92  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  20.56 
 
 		 721 aa  91.3  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  18.2 
 
 		 757 aa  91.3  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  20.61 
 
 		 716 aa  90.9  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  20.27 
 
 		 720 aa  90.9  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  19.86 
 
 		 746 aa  90.9  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  20.53 
 
 		 722 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>