More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1135 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
745 aa  1530    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  57.36 
 
 
753 aa  828    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  44.23 
 
 
772 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.46 
 
 
739 aa  509  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  37.91 
 
 
756 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.97 
 
 
748 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  36.78 
 
 
782 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  36.21 
 
 
758 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  35.94 
 
 
758 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.37 
 
 
764 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.8 
 
 
750 aa  405  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  34.17 
 
 
788 aa  402  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  33.87 
 
 
776 aa  398  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  31.54 
 
 
778 aa  392  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.97 
 
 
779 aa  362  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  31.79 
 
 
756 aa  333  7.000000000000001e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  30.63 
 
 
789 aa  326  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.71 
 
 
751 aa  320  7.999999999999999e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  30.94 
 
 
771 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  30.94 
 
 
789 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  30.6 
 
 
790 aa  306  8.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.23 
 
 
785 aa  294  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  29.64 
 
 
734 aa  279  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  29.89 
 
 
750 aa  266  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 
737 aa  254  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  28.53 
 
 
738 aa  244  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  25.93 
 
 
755 aa  240  8e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.38 
 
 
730 aa  239  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  26.18 
 
 
743 aa  237  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  26.66 
 
 
770 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  26.65 
 
 
710 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  27.69 
 
 
779 aa  228  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  25.49 
 
 
756 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  27.29 
 
 
731 aa  221  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  26.45 
 
 
726 aa  221  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  25.72 
 
 
738 aa  217  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  26.01 
 
 
756 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1073  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.22 
 
 
728 aa  212  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649181  normal  0.290523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 
701 aa  211  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  26.62 
 
 
753 aa  209  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  25.35 
 
 
772 aa  200  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  32.59 
 
 
764 aa  190  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.69 
 
 
696 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  25.07 
 
 
711 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.64 
 
 
478 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.29 
 
 
595 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  24.21 
 
 
727 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  26.82 
 
 
774 aa  173  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 
759 aa  172  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  29.49 
 
 
687 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.56 
 
 
491 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  25.03 
 
 
737 aa  170  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  27.74 
 
 
872 aa  169  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  23.98 
 
 
721 aa  167  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  26.04 
 
 
688 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.35 
 
 
707 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.02 
 
 
707 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  27.87 
 
 
572 aa  165  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  27.87 
 
 
572 aa  165  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.83 
 
 
548 aa  163  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 
491 aa  162  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  23.85 
 
 
745 aa  160  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 
731 aa  160  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.58 
 
 
537 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  25.1 
 
 
741 aa  157  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 
804 aa  156  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  25.21 
 
 
733 aa  154  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  24.66 
 
 
527 aa  153  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.22 
 
 
734 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.6 
 
 
776 aa  153  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  31.82 
 
 
763 aa  152  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  23.07 
 
 
790 aa  152  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  26.42 
 
 
729 aa  151  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  23.91 
 
 
806 aa  150  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 
704 aa  150  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0387  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.98 
 
 
509 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  24.67 
 
 
803 aa  147  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  30.75 
 
 
713 aa  147  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  24.14 
 
 
709 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 
718 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  26.23 
 
 
773 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  26.23 
 
 
742 aa  145  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  25.57 
 
 
727 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  24.5 
 
 
742 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  26.76 
 
 
715 aa  141  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  23.63 
 
 
797 aa  139  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.77 
 
 
784 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  22.53 
 
 
736 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.47 
 
 
737 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4353  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.57 
 
 
537 aa  135  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201059  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.97 
 
 
759 aa  135  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  24.92 
 
 
735 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  26 
 
 
769 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  25.21 
 
 
722 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.39 
 
 
722 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 
749 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0181  non-specific protein-tyrosine kinase  24.31 
 
 
731 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.5 
 
 
774 aa  128  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  24.08 
 
 
803 aa  128  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  28.08 
 
 
524 aa  128  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>