More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5886 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
750 aa  1491    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  36.87 
 
 
753 aa  445  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.82 
 
 
745 aa  431  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  37.93 
 
 
782 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  36.8 
 
 
756 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  33.73 
 
 
772 aa  405  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.76 
 
 
748 aa  405  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  34.69 
 
 
758 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  34.61 
 
 
758 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.04 
 
 
739 aa  388  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.27 
 
 
764 aa  363  9e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  33.87 
 
 
776 aa  355  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.28 
 
 
779 aa  333  6e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  31.53 
 
 
788 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  33.61 
 
 
778 aa  323  9.000000000000001e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.06 
 
 
751 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  31.1 
 
 
789 aa  297  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  29.25 
 
 
771 aa  276  7e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  29.25 
 
 
789 aa  276  8e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  30.6 
 
 
790 aa  265  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  28.81 
 
 
756 aa  264  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  29.42 
 
 
750 aa  248  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  28.48 
 
 
734 aa  235  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.83 
 
 
785 aa  224  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 
730 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  26.1 
 
 
743 aa  217  8e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 
759 aa  204  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.69 
 
 
738 aa  202  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1073  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.48 
 
 
728 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649181  normal  0.290523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  27.68 
 
 
710 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  24.29 
 
 
755 aa  190  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  25.85 
 
 
753 aa  190  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  30.62 
 
 
764 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  24.75 
 
 
756 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 
737 aa  174  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  26.55 
 
 
779 aa  173  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 
738 aa  171  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  22.62 
 
 
756 aa  162  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  23.68 
 
 
726 aa  158  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.85 
 
 
701 aa  158  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  24.74 
 
 
745 aa  158  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  23.9 
 
 
721 aa  157  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  26.52 
 
 
774 aa  154  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 
776 aa  153  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  22.72 
 
 
731 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  26.19 
 
 
711 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  25.46 
 
 
727 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.08 
 
 
537 aa  149  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.7 
 
 
595 aa  147  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  24.76 
 
 
733 aa  147  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.01 
 
 
720 aa  146  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 
548 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  25.81 
 
 
688 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.25 
 
 
491 aa  144  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  22.71 
 
 
734 aa  142  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.45 
 
 
491 aa  142  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4353  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.31 
 
 
537 aa  140  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201059  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4129  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 
734 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  24.31 
 
 
742 aa  140  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4497  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 
734 aa  139  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.904654  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  26.93 
 
 
572 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  26.93 
 
 
572 aa  137  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  26.85 
 
 
687 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  24.2 
 
 
737 aa  134  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3692  lipopolysaccharide biosynthesis  25.14 
 
 
736 aa  134  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.306041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  24.14 
 
 
773 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  26.51 
 
 
713 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  25.8 
 
 
736 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  22.78 
 
 
872 aa  132  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.05 
 
 
770 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 
696 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  26.86 
 
 
715 aa  131  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  26.42 
 
 
742 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  22.24 
 
 
772 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  23.04 
 
 
797 aa  128  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.75 
 
 
722 aa  127  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  32.89 
 
 
496 aa  126  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.32 
 
 
804 aa  126  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4611  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 
743 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  26.1 
 
 
464 aa  125  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6092  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.71 
 
 
730 aa  124  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666238  decreased coverage  0.00184203 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 
707 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  26.41 
 
 
763 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.29 
 
 
724 aa  121  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  26.27 
 
 
735 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  25.09 
 
 
747 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 
704 aa  120  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  28.94 
 
 
747 aa  120  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  24.89 
 
 
769 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  30.23 
 
 
454 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.37 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  23.23 
 
 
753 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 
707 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.47 
 
 
784 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  32.37 
 
 
217 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.95 
 
 
478 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0387  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.58 
 
 
509 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.27 
 
 
720 aa  118  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0181  non-specific protein-tyrosine kinase  26.83 
 
 
731 aa  117  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 
749 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>