153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4210 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 548 aa  1091    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  88.69 
 
 		 537 aa  908    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.54 
 
 		 595 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  33.05 
 
 		 572 aa  221  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  33.05 
 
 		 572 aa  219  7.999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  29.41 
 
 		 764 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4353  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.56 
 
 		 537 aa  194  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201059  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.11 
 
 		 701 aa  177  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 		 491 aa  177  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.26 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.59 
 
 		 696 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0387  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.19 
 
 		 509 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.63 
 
 		 707 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.63 
 
 		 707 aa  163  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.99 
 
 		 745 aa  163  8.000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2874  lipopolysaccharide biosynthesis  29.21 
 
 		 515 aa  162  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  30.4 
 
 		 688 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  29.3 
 
 		 687 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  27.68 
 
 		 753 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  26.76 
 
 		 750 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  28.28 
 
 		 788 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  25.93 
 
 		 756 aa  144  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.54 
 
 		 478 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.03 
 
 		 739 aa  141  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  27.25 
 
 		 782 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  27.81 
 
 		 734 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6014  exopolysaccharide polymerization/transport protein  27.43 
 
 		 737 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807866  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 748 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 764 aa  130  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  24.53 
 
 		 756 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  26.2 
 
 		 710 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.34 
 
 		 750 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  25.93 
 
 		 776 aa  128  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  26.43 
 
 		 772 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  25.33 
 
 		 790 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  26.94 
 
 		 758 aa  124  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.68 
 
 		 718 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  26.7 
 
 		 747 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  28.66 
 
 		 778 aa  120  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  24.48 
 
 		 758 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 724 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 		 751 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.36 
 
 		 785 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 726 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.34 
 
 		 779 aa  109  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  25.39 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  25.85 
 
 		 735 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  23.71 
 
 		 738 aa  107  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  23.47 
 
 		 789 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  25.49 
 
 		 709 aa  103  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  26.53 
 
 		 720 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.1 
 
 		 704 aa  100  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 784 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  25.4 
 
 		 475 aa  97.4  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  23.03 
 
 		 770 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  20.53 
 
 		 872 aa  96.3  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  24.58 
 
 		 713 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  24.23 
 
 		 771 aa  95.1  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  25.44 
 
 		 773 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  24.23 
 
 		 789 aa  95.1  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 467 aa  94  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  23.88 
 
 		 466 aa  93.6  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  22.6 
 
 		 715 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  24.49 
 
 		 769 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 766 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  24.82 
 
 		 742 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  19.29 
 
 		 737 aa  92.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  25 
 
 		 711 aa  92  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  23.3 
 
 		 756 aa  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 		 730 aa  90.9  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  24.03 
 
 		 774 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  20.75 
 
 		 756 aa  87  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.92 
 
 		 759 aa  85.9  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  22.49 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  25.46 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 776 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  27.33 
 
 		 738 aa  82.4  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 804 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 		 804 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  21.3 
 
 		 743 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  25.62 
 
 		 737 aa  80.9  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  24.89 
 
 		 763 aa  81.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  22.89 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.12 
 
 		 755 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6092  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 		 730 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666238  decreased coverage  0.00184203 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  23 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0181  non-specific protein-tyrosine kinase  22.69 
 
 		 731 aa  77  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.5 
 
 		 737 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  21.97 
 
 		 779 aa  75.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1457  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.51 
 
 		 576 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  26.6 
 
 		 729 aa  75.1  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0243  lipopolysaccharide biosynthesis  23.37 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 731 aa  74.7  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 774 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  21.28 
 
 		 499 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  19.28 
 
 		 708 aa  72  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  20.19 
 
 		 753 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  21.28 
 
 		 731 aa  70.9  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.65 
 
 		 749 aa  71.2  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  21.52 
 
 		 772 aa  70.5  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>