More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2561 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  100 
 
 		 771 aa  1563    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  99.87 
 
 		 789 aa  1560    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  91.18 
 
 		 789 aa  1415    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  39.39 
 
 		 776 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  37.68 
 
 		 778 aa  478  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  36.02 
 
 		 788 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  35.25 
 
 		 758 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  34.85 
 
 		 758 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.94 
 
 		 764 aa  343  7e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.13 
 
 		 739 aa  340  5e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  30.78 
 
 		 772 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.41 
 
 		 745 aa  321  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  29.33 
 
 		 753 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.73 
 
 		 779 aa  299  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  29.46 
 
 		 756 aa  287  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.52 
 
 		 750 aa  277  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.72 
 
 		 748 aa  272  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  29.68 
 
 		 782 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.79 
 
 		 751 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  27.21 
 
 		 734 aa  227  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  26.36 
 
 		 755 aa  224  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  28.8 
 
 		 756 aa  220  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  25.85 
 
 		 756 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 738 aa  197  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  27.69 
 
 		 710 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  26.41 
 
 		 790 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  23.96 
 
 		 743 aa  185  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  24.87 
 
 		 738 aa  180  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.1 
 
 		 785 aa  180  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  23.96 
 
 		 721 aa  165  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  24.35 
 
 		 756 aa  165  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  24.6 
 
 		 753 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 730 aa  164  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  25.46 
 
 		 750 aa  160  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 		 759 aa  160  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1073  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.22 
 
 		 728 aa  159  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649181  normal  0.290523 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  25.37 
 
 		 733 aa  158  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  25.08 
 
 		 734 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  23.5 
 
 		 779 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  23.69 
 
 		 872 aa  152  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.17 
 
 		 804 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  25.04 
 
 		 770 aa  145  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 737 aa  143  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.63 
 
 		 595 aa  143  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  23.62 
 
 		 737 aa  140  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  21.74 
 
 		 731 aa  139  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  24.31 
 
 		 790 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  31.36 
 
 		 454 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0181  non-specific protein-tyrosine kinase  27.71 
 
 		 731 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  23.43 
 
 		 806 aa  132  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  24.17 
 
 		 820 aa  131  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.68 
 
 		 704 aa  131  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  22.92 
 
 		 745 aa  131  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  21.76 
 
 		 726 aa  130  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  24.83 
 
 		 772 aa  128  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  24.03 
 
 		 727 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  26.23 
 
 		 736 aa  127  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  25.47 
 
 		 802 aa  125  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 491 aa  125  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  25.71 
 
 		 741 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 749 aa  124  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  24.22 
 
 		 527 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 		 731 aa  123  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  24.74 
 
 		 729 aa  120  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  25.27 
 
 		 722 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0764  protein-tyrosine kinase  24 
 
 		 763 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0280941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  25.96 
 
 		 721 aa  120  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  24.54 
 
 		 741 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  25.74 
 
 		 778 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 776 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  24.53 
 
 		 572 aa  114  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  24.53 
 
 		 572 aa  114  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  27.19 
 
 		 464 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  27.51 
 
 		 466 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  23.44 
 
 		 742 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.21 
 
 		 720 aa  112  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  23.69 
 
 		 711 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  31.94 
 
 		 503 aa  112  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3692  lipopolysaccharide biosynthesis  27.3 
 
 		 736 aa  111  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.306041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  26.43 
 
 		 740 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  33.05 
 
 		 233 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  21.53 
 
 		 708 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  29.14 
 
 		 496 aa  110  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  23.38 
 
 		 739 aa  110  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  25.75 
 
 		 747 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  25.66 
 
 		 746 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.97 
 
 		 720 aa  109  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  33.05 
 
 		 233 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  26.86 
 
 		 766 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  27.61 
 
 		 667 aa  109  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  32.63 
 
 		 233 aa  108  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6092  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.83 
 
 		 730 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666238  decreased coverage  0.00184203 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  29.9 
 
 		 463 aa  108  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  26.1 
 
 		 732 aa  108  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.81 
 
 		 701 aa  108  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  24.31 
 
 		 774 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  32.63 
 
 		 233 aa  107  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  32.2 
 
 		 233 aa  107  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  24.56 
 
 		 750 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.16 
 
 		 741 aa  107  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>