More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3692 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3692  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 736 aa  1451    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.306041 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.09 
 
 		 735 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573901  normal  0.403128 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6432  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.96 
 
 		 734 aa  337  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.402351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.86 
 
 		 738 aa  171  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.06 
 
 		 734 aa  164  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  26.52 
 
 		 734 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  24.75 
 
 		 772 aa  157  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 737 aa  152  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.56 
 
 		 739 aa  152  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  24.76 
 
 		 753 aa  148  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  26.66 
 
 		 756 aa  147  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  25.85 
 
 		 745 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 750 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  24.59 
 
 		 756 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  24.48 
 
 		 710 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  27.39 
 
 		 789 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 		 804 aa  128  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  24.67 
 
 		 753 aa  125  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  26.23 
 
 		 756 aa  123  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  23.8 
 
 		 772 aa  122  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.82 
 
 		 726 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  29.82 
 
 		 726 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.82 
 
 		 726 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.82 
 
 		 726 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  29.82 
 
 		 726 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.82 
 
 		 726 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.82 
 
 		 726 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  25.33 
 
 		 758 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.82 
 
 		 726 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  29.81 
 
 		 735 aa  120  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  24.04 
 
 		 750 aa  120  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  25.65 
 
 		 758 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  24.68 
 
 		 872 aa  120  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  23.75 
 
 		 797 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  26.96 
 
 		 771 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 		 730 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  26.96 
 
 		 789 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  23.67 
 
 		 742 aa  117  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 751 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  23.26 
 
 		 756 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  30.65 
 
 		 496 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  25.13 
 
 		 743 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.02 
 
 		 745 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  35.91 
 
 		 726 aa  115  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  29.64 
 
 		 723 aa  115  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 748 aa  114  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  23.68 
 
 		 779 aa  114  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  25.34 
 
 		 747 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  24.1 
 
 		 721 aa  112  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 764 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  28.8 
 
 		 753 aa  111  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1523  non-specific protein-tyrosine kinase  31.12 
 
 		 718 aa  110  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  25.19 
 
 		 727 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  27.84 
 
 		 731 aa  110  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  28.33 
 
 		 755 aa  109  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  25 
 
 		 782 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  25.85 
 
 		 722 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  25.17 
 
 		 790 aa  107  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  25.62 
 
 		 746 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  24.35 
 
 		 726 aa  104  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 731 aa  104  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 		 749 aa  104  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 759 aa  103  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  23.73 
 
 		 759 aa  103  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  26.4 
 
 		 724 aa  103  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.24 
 
 		 779 aa  103  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  26.45 
 
 		 790 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 738 aa  103  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.65 
 
 		 217 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  33.17 
 
 		 217 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  34.41 
 
 		 751 aa  101  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  22.81 
 
 		 755 aa  100  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  32.41 
 
 		 747 aa  100  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  31.96 
 
 		 747 aa  100  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  31.56 
 
 		 722 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  22.13 
 
 		 750 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  25.81 
 
 		 741 aa  99.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  25.58 
 
 		 746 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  26.23 
 
 		 724 aa  99  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.9 
 
 		 736 aa  99  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2153  capsular exopolysaccharide family  25.59 
 
 		 713 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  25.63 
 
 		 745 aa  98.2  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 		 724 aa  98.2  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  32.6 
 
 		 747 aa  97.4  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  25.51 
 
 		 734 aa  96.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.18 
 
 		 482 aa  96.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  26.3 
 
 		 778 aa  95.9  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  33.51 
 
 		 454 aa  96.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  26.47 
 
 		 723 aa  95.9  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  21.56 
 
 		 802 aa  96.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  28.94 
 
 		 624 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  24.92 
 
 		 464 aa  95.5  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 		 726 aa  95.5  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  31.07 
 
 		 233 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  25.31 
 
 		 747 aa  95.1  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  24.31 
 
 		 788 aa  95.1  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  22.31 
 
 		 741 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  27.81 
 
 		 790 aa  94.7  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 780 aa  95.1  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  27.67 
 
 		 727 aa  94.7  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>