More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6236 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6432  lipopolysaccharide biosynthesis protein  65.67 
 
 		 734 aa  951    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.402351 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 735 aa  1486    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573901  normal  0.403128 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3692  lipopolysaccharide biosynthesis  35.09 
 
 		 736 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.306041 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  25.71 
 
 		 738 aa  163  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  25 
 
 		 734 aa  162  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.87 
 
 		 743 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  24.03 
 
 		 756 aa  152  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  24.38 
 
 		 756 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  25.73 
 
 		 756 aa  145  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  24.36 
 
 		 753 aa  135  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  24.4 
 
 		 755 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.62 
 
 		 739 aa  130  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  27.11 
 
 		 750 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  21.8 
 
 		 772 aa  127  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 730 aa  125  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  22.05 
 
 		 721 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  21.85 
 
 		 734 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  24.3 
 
 		 753 aa  119  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 		 804 aa  117  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  21.52 
 
 		 872 aa  117  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.28 
 
 		 779 aa  115  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 745 aa  115  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1523  non-specific protein-tyrosine kinase  29.09 
 
 		 718 aa  114  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  23.63 
 
 		 772 aa  114  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 		 751 aa  114  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  23.71 
 
 		 778 aa  112  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  23.09 
 
 		 756 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  23.91 
 
 		 782 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  22.5 
 
 		 742 aa  107  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  23.03 
 
 		 770 aa  107  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  20.31 
 
 		 737 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  30.66 
 
 		 454 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 749 aa  105  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  23.2 
 
 		 797 aa  103  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  24.12 
 
 		 774 aa  103  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  23.53 
 
 		 806 aa  103  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  24.4 
 
 		 745 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  24.46 
 
 		 802 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 		 738 aa  101  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.84 
 
 		 779 aa  101  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  25.17 
 
 		 790 aa  100  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  21.51 
 
 		 726 aa  100  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 750 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  23.22 
 
 		 788 aa  97.4  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  21.3 
 
 		 731 aa  95.9  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  22.54 
 
 		 710 aa  95.5  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  31.31 
 
 		 463 aa  95.5  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  23.18 
 
 		 790 aa  95.5  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 764 aa  94.7  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.2 
 
 		 739 aa  94  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  23.04 
 
 		 722 aa  94  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  21.82 
 
 		 771 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.79 
 
 		 748 aa  92.8  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  22.59 
 
 		 741 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  26.01 
 
 		 753 aa  91.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  21.77 
 
 		 789 aa  90.9  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  21.05 
 
 		 758 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  28.65 
 
 		 624 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.82 
 
 		 711 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 		 759 aa  87.8  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  22.61 
 
 		 789 aa  87.8  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2866  exopolysaccharide transporter  33.85 
 
 		 764 aa  87.8  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.19 
 
 		 217 aa  87.4  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4129  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 		 734 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4497  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 734 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.904654  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.25 
 
 		 720 aa  86.7  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  26.52 
 
 		 529 aa  86.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  35.37 
 
 		 745 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  20.24 
 
 		 758 aa  85.5  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  27.51 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  25.18 
 
 		 715 aa  85.1  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 		 776 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0342  protein-tyrosine kinase  26.45 
 
 		 554 aa  85.1  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0461311 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.86 
 
 		 722 aa  84.7  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  23.48 
 
 		 739 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  28.02 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  29.21 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  28.57 
 
 		 527 aa  84.3  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  25.03 
 
 		 735 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  24.82 
 
 		 820 aa  84  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  34.76 
 
 		 745 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  31.5 
 
 		 751 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  27.42 
 
 		 521 aa  83.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  34.76 
 
 		 745 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  25.22 
 
 		 740 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  28.46 
 
 		 524 aa  82.8  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 785 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  22.92 
 
 		 737 aa  81.6  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4611  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 743 aa  81.6  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  24.92 
 
 		 667 aa  80.9  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  27.52 
 
 		 747 aa  80.9  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  21.3 
 
 		 739 aa  80.9  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  24.47 
 
 		 790 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.85 
 
 		 724 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.87 
 
 		 741 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  21.49 
 
 		 796 aa  79.3  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  22.87 
 
 		 741 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  27.73 
 
 		 721 aa  79.7  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  22.87 
 
 		 741 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.17 
 
 		 741 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>