More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2405 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 
872 aa  1790    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  29.82 
 
 
737 aa  287  7e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  31.4 
 
 
730 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  30.91 
 
 
726 aa  266  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  29.92 
 
 
756 aa  257  6e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  30.96 
 
 
731 aa  254  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  29.19 
 
 
755 aa  254  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  29.62 
 
 
738 aa  252  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  26.48 
 
 
770 aa  244  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  28.68 
 
 
756 aa  236  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  28.1 
 
 
734 aa  235  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  26.25 
 
 
756 aa  225  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  27.79 
 
 
779 aa  219  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  25.92 
 
 
743 aa  211  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  26.92 
 
 
797 aa  209  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  27.64 
 
 
753 aa  206  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  26.86 
 
 
721 aa  205  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  27.4 
 
 
750 aa  202  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  25.59 
 
 
738 aa  191  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  27.99 
 
 
772 aa  189  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  26.4 
 
 
710 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  30.2 
 
 
527 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  23.56 
 
 
790 aa  185  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  26.05 
 
 
758 aa  184  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  25.91 
 
 
711 aa  180  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  25.52 
 
 
758 aa  177  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  23.33 
 
 
753 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  25.87 
 
 
737 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  25.48 
 
 
776 aa  172  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  24.6 
 
 
788 aa  172  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.87 
 
 
745 aa  169  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.36 
 
 
806 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.86 
 
 
739 aa  168  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  23.58 
 
 
772 aa  167  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 
759 aa  167  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  24.41 
 
 
727 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 
804 aa  157  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 
748 aa  156  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  25.08 
 
 
745 aa  156  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  23.81 
 
 
778 aa  153  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  25.12 
 
 
789 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  26.45 
 
 
466 aa  149  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 
467 aa  145  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.53 
 
 
720 aa  144  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  23.73 
 
 
733 aa  144  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 
764 aa  144  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  26.16 
 
 
472 aa  143  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  24.05 
 
 
756 aa  142  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.72 
 
 
739 aa  141  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  24.3 
 
 
790 aa  140  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  23.3 
 
 
789 aa  140  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  23.17 
 
 
771 aa  140  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  22.07 
 
 
774 aa  140  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  25.05 
 
 
734 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  24.94 
 
 
739 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  24.4 
 
 
739 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  22.9 
 
 
782 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  24.4 
 
 
739 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  24.4 
 
 
739 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  35.42 
 
 
464 aa  132  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  21.98 
 
 
753 aa  131  6e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.18 
 
 
722 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  21.8 
 
 
708 aa  129  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.01 
 
 
779 aa  128  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.92 
 
 
720 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.72 
 
 
776 aa  125  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  25.22 
 
 
722 aa  124  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.64 
 
 
741 aa  124  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  22.64 
 
 
741 aa  124  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  23.5 
 
 
820 aa  124  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  23.25 
 
 
741 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.18 
 
 
741 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  23.18 
 
 
741 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  23.18 
 
 
741 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  23.06 
 
 
732 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  25.72 
 
 
741 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 
704 aa  121  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.99 
 
 
724 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  22.08 
 
 
750 aa  120  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  24.15 
 
 
741 aa  120  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  23.06 
 
 
740 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 
726 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  22.84 
 
 
469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  24.58 
 
 
747 aa  118  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.79 
 
 
741 aa  118  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 
701 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 
778 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 
735 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573901  normal  0.403128 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6432  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 
734 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.402351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  23.21 
 
 
741 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 
751 aa  115  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  21.39 
 
 
722 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  21.43 
 
 
720 aa  114  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  21.44 
 
 
726 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  21.44 
 
 
726 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  21.44 
 
 
726 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  21.44 
 
 
726 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  21.44 
 
 
726 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  21.44 
 
 
726 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  21.44 
 
 
726 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>