137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0101 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  100 
 
 
572 aa  1142    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  99.65 
 
 
572 aa  1139    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  66.17 
 
 
595 aa  737    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.61 
 
 
701 aa  230  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.19 
 
 
491 aa  224  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  35.59 
 
 
764 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.13 
 
 
537 aa  220  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.05 
 
 
548 aa  217  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.72 
 
 
491 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.7 
 
 
478 aa  193  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.95 
 
 
707 aa  190  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.95 
 
 
707 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.64 
 
 
696 aa  180  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2874  lipopolysaccharide biosynthesis  32.61 
 
 
515 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  29.54 
 
 
756 aa  172  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  32.7 
 
 
688 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.46 
 
 
745 aa  169  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  30.56 
 
 
687 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  27.14 
 
 
750 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0387  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.43 
 
 
509 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  30.38 
 
 
782 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4353  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.22 
 
 
537 aa  156  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201059  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.66 
 
 
748 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.94 
 
 
739 aa  155  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  24.94 
 
 
758 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  25.27 
 
 
758 aa  150  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  27.33 
 
 
753 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6014  exopolysaccharide polymerization/transport protein  29.95 
 
 
737 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807866  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  29.31 
 
 
734 aa  139  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.61 
 
 
764 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  25.44 
 
 
756 aa  130  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.75 
 
 
779 aa  124  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 
750 aa  123  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  24.68 
 
 
710 aa  123  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 
724 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 
737 aa  121  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 
751 aa  120  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 
726 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  30.21 
 
 
720 aa  118  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  25.4 
 
 
772 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  22.51 
 
 
756 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  27.59 
 
 
738 aa  117  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  24.68 
 
 
788 aa  116  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  23.02 
 
 
743 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  25.71 
 
 
776 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  26.43 
 
 
747 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.58 
 
 
755 aa  108  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.16 
 
 
778 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.44 
 
 
718 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 
730 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  24.29 
 
 
771 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  24.29 
 
 
789 aa  104  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  25.22 
 
 
711 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  22.32 
 
 
756 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 
738 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 
759 aa  101  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  26.89 
 
 
709 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  24.58 
 
 
472 aa  100  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  29.41 
 
 
713 aa  100  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  22.89 
 
 
789 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.12 
 
 
766 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 
731 aa  98.6  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  21.28 
 
 
790 aa  97.1  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 
731 aa  97.1  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  27.16 
 
 
715 aa  95.9  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  26.52 
 
 
742 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  26.67 
 
 
769 aa  94.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  26.5 
 
 
773 aa  94  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.74 
 
 
784 aa  93.6  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  24.46 
 
 
729 aa  92.8  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  27.44 
 
 
770 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  27.2 
 
 
735 aa  91.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 
737 aa  92  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 
467 aa  90.9  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  23.45 
 
 
466 aa  89  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  26.15 
 
 
763 aa  88.2  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.22 
 
 
804 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.22 
 
 
804 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  22.19 
 
 
721 aa  84  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0359  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  25.12 
 
 
720 aa  83.6  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.302004  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  21.55 
 
 
872 aa  82.4  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.8 
 
 
774 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  21.79 
 
 
461 aa  80.5  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 
704 aa  80.5  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  23.01 
 
 
737 aa  80.9  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  24.38 
 
 
726 aa  80.9  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  24.59 
 
 
472 aa  80.5  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  26.16 
 
 
727 aa  80.1  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 
776 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.09 
 
 
785 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  22.8 
 
 
779 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0352  putative succinoglycan biosynthesis transport protein  26.78 
 
 
601 aa  76.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0570325  normal  0.193411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.93 
 
 
759 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  21.6 
 
 
753 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0384  putative succinoglycan biosynthesis transport protein  26.76 
 
 
590 aa  75.5  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  21.81 
 
 
472 aa  74.7  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1457  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.61 
 
 
576 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  22.45 
 
 
466 aa  74.3  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.3 
 
 
749 aa  74.3  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  26.04 
 
 
527 aa  72.8  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>