More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5599 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 776 aa  1542    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4129  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.51 
 
 		 734 aa  330  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4497  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.51 
 
 		 734 aa  327  7e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.904654  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4611  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.39 
 
 		 743 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  29.18 
 
 		 738 aa  209  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  25.42 
 
 		 758 aa  184  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  27.58 
 
 		 753 aa  184  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  25.87 
 
 		 756 aa  183  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  25.59 
 
 		 758 aa  180  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  26.19 
 
 		 743 aa  180  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  25.73 
 
 		 734 aa  173  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 		 748 aa  171  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  26.26 
 
 		 782 aa  170  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 		 737 aa  170  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  24.69 
 
 		 756 aa  169  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 745 aa  168  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  24.19 
 
 		 755 aa  164  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 738 aa  162  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  23.13 
 
 		 756 aa  161  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  28.28 
 
 		 750 aa  160  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  24.65 
 
 		 778 aa  160  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  24.12 
 
 		 756 aa  156  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 		 764 aa  153  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.78 
 
 		 739 aa  152  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  24.13 
 
 		 772 aa  151  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 730 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  24.14 
 
 		 788 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 759 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.53 
 
 		 770 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  25.74 
 
 		 776 aa  147  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 750 aa  145  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.97 
 
 		 779 aa  140  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  26.42 
 
 		 790 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  24.57 
 
 		 721 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  23.17 
 
 		 753 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  22.87 
 
 		 779 aa  132  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  25.51 
 
 		 872 aa  131  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.76 
 
 		 704 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  23.32 
 
 		 726 aa  125  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.91 
 
 		 711 aa  124  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1523  non-specific protein-tyrosine kinase  27.36 
 
 		 718 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  24.2 
 
 		 710 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  21.17 
 
 		 745 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  21.86 
 
 		 737 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 		 731 aa  114  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  24.44 
 
 		 789 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  24.26 
 
 		 733 aa  114  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.38 
 
 		 747 aa  112  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.77 
 
 		 737 aa  112  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.04 
 
 		 804 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.87 
 
 		 491 aa  109  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 		 784 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 		 701 aa  109  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  24.76 
 
 		 771 aa  108  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  23.37 
 
 		 727 aa  108  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  24.76 
 
 		 789 aa  108  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0181  non-specific protein-tyrosine kinase  25.6 
 
 		 731 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  25.46 
 
 		 715 aa  107  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  25.52 
 
 		 713 aa  107  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  26.16 
 
 		 527 aa  106  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  24.83 
 
 		 742 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  25.8 
 
 		 709 aa  106  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  22.44 
 
 		 774 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.37 
 
 		 774 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 		 759 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.15 
 
 		 595 aa  103  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  23.67 
 
 		 729 aa  102  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  21.12 
 
 		 708 aa  101  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  21.22 
 
 		 772 aa  101  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 		 731 aa  101  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  24.56 
 
 		 773 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 735 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573901  normal  0.403128 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  25.9 
 
 		 735 aa  99  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 		 749 aa  99.4  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  25.8 
 
 		 763 aa  99  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  28.68 
 
 		 720 aa  98.6  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  23.6 
 
 		 806 aa  98.2  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 548 aa  97.8  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  27.83 
 
 		 741 aa  97.8  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 		 537 aa  96.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  27.14 
 
 		 764 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  24.26 
 
 		 769 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  23.85 
 
 		 722 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  26.36 
 
 		 572 aa  94.7  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  26.36 
 
 		 572 aa  94.7  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 724 aa  94.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.37 
 
 		 724 aa  93.6  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 		 726 aa  93.2  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6092  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.91 
 
 		 730 aa  92  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666238  decreased coverage  0.00184203 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.48 
 
 		 722 aa  91.3  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  21.67 
 
 		 742 aa  90.9  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 		 766 aa  90.9  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.06 
 
 		 720 aa  90.5  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4353  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 537 aa  90.1  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201059  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 718 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  23.85 
 
 		 727 aa  89.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  23.73 
 
 		 795 aa  89.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  25.16 
 
 		 466 aa  88.2  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  23.3 
 
 		 472 aa  87.8  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  21.05 
 
 		 797 aa  87.8  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>