194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1157 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  100 
 
 		 720 aa  1411    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  46.24 
 
 		 735 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  42.3 
 
 		 709 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  40.52 
 
 		 747 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.59 
 
 		 724 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.12 
 
 		 726 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  36.64 
 
 		 715 aa  347  5e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  36.5 
 
 		 713 aa  340  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  35.56 
 
 		 773 aa  330  6e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  35.49 
 
 		 769 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.73 
 
 		 784 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  34.57 
 
 		 763 aa  313  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  41.92 
 
 		 742 aa  310  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.91 
 
 		 737 aa  287  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.13 
 
 		 774 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  34.33 
 
 		 738 aa  280  5e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.65 
 
 		 766 aa  261  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.54 
 
 		 759 aa  251  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.18 
 
 		 804 aa  248  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.11 
 
 		 804 aa  245  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  26.56 
 
 		 756 aa  171  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  27.69 
 
 		 737 aa  161  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  24.79 
 
 		 753 aa  161  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  27.43 
 
 		 756 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  24.26 
 
 		 758 aa  150  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.1 
 
 		 734 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  24.12 
 
 		 756 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  24.89 
 
 		 782 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.66 
 
 		 748 aa  148  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  26 
 
 		 688 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  24.85 
 
 		 772 aa  144  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.47 
 
 		 701 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_004310  BR0785  hypothetical protein  43.37 
 
 		 220 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0778  hypothetical protein  43.37 
 
 		 220 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.79 
 
 		 739 aa  142  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  23.8 
 
 		 758 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.77 
 
 		 696 aa  139  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.72 
 
 		 745 aa  137  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  24.18 
 
 		 750 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.84 
 
 		 755 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  24.92 
 
 		 778 aa  135  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  25.04 
 
 		 788 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.26 
 
 		 595 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.28 
 
 		 743 aa  132  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  25.89 
 
 		 710 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 731 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  28.7 
 
 		 572 aa  124  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 		 764 aa  123  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  28.7 
 
 		 572 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  22.86 
 
 		 797 aa  120  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  24.49 
 
 		 687 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  23.79 
 
 		 727 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  27.68 
 
 		 753 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0181  non-specific protein-tyrosine kinase  28.84 
 
 		 731 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  23.9 
 
 		 737 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.3 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 		 751 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  22.64 
 
 		 779 aa  115  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  23.03 
 
 		 738 aa  115  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 730 aa  114  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  23.01 
 
 		 721 aa  114  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  28.57 
 
 		 790 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.05 
 
 		 759 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  26.41 
 
 		 764 aa  111  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.88 
 
 		 750 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 		 467 aa  109  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.28 
 
 		 537 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  28.97 
 
 		 711 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  21.47 
 
 		 708 aa  108  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.53 
 
 		 548 aa  108  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  22.79 
 
 		 734 aa  107  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 707 aa  106  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.21 
 
 		 478 aa  106  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 707 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  25.66 
 
 		 466 aa  106  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  23.88 
 
 		 774 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 		 718 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6014  exopolysaccharide polymerization/transport protein  26.44 
 
 		 737 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807866  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  23.5 
 
 		 726 aa  102  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4353  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 		 537 aa  102  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201059  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  26.36 
 
 		 776 aa  99  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.7 
 
 		 731 aa  99.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3557  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 710 aa  96.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  22.8 
 
 		 733 aa  97.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  27.48 
 
 		 729 aa  96.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  24.89 
 
 		 466 aa  95.5  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  22.38 
 
 		 745 aa  95.5  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0587  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 710 aa  93.6  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  22.36 
 
 		 756 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  24.84 
 
 		 472 aa  92.8  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 491 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  21.66 
 
 		 772 aa  92.8  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 704 aa  92.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.11 
 
 		 722 aa  91.3  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  22.63 
 
 		 872 aa  91.3  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  26.44 
 
 		 771 aa  90.9  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  26.08 
 
 		 789 aa  90.9  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  24.39 
 
 		 461 aa  90.1  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  26.57 
 
 		 472 aa  89  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  25.79 
 
 		 789 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>