208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5390 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
491 aa  971    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  49.66 
 
 
478 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  40.33 
 
 
701 aa  267  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  36.77 
 
 
764 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38 
 
 
491 aa  234  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.6 
 
 
707 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.56 
 
 
696 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.6 
 
 
707 aa  233  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  35.09 
 
 
572 aa  227  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.24 
 
 
595 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  35.09 
 
 
572 aa  226  8e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4353  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.11 
 
 
537 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201059  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  33.78 
 
 
756 aa  219  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0387  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.57 
 
 
509 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  34.42 
 
 
687 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  33.11 
 
 
688 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.08 
 
 
748 aa  196  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.81 
 
 
537 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.8 
 
 
548 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  32.54 
 
 
750 aa  187  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2874  lipopolysaccharide biosynthesis  31.72 
 
 
515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.33 
 
 
745 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  29.8 
 
 
758 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.15 
 
 
739 aa  182  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  32.83 
 
 
713 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  30.15 
 
 
788 aa  181  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  29.58 
 
 
758 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  31.14 
 
 
753 aa  179  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  29.35 
 
 
778 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  32.06 
 
 
715 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  32.18 
 
 
742 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  30.41 
 
 
772 aa  171  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  32.47 
 
 
773 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  34.68 
 
 
763 aa  169  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  29.14 
 
 
776 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  31.96 
 
 
769 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  30.02 
 
 
756 aa  163  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  31.25 
 
 
734 aa  160  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  29.63 
 
 
782 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.21 
 
 
784 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.06 
 
 
718 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.24 
 
 
764 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.74 
 
 
779 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6014  exopolysaccharide polymerization/transport protein  30.02 
 
 
737 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  28.82 
 
 
710 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.69 
 
 
774 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.11 
 
 
766 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  28.76 
 
 
738 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.72 
 
 
737 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.96 
 
 
759 aa  136  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.4 
 
 
724 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.17 
 
 
759 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.9 
 
 
750 aa  133  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.93 
 
 
726 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  27.11 
 
 
790 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.96 
 
 
751 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  27.06 
 
 
747 aa  127  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.89 
 
 
730 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  30.61 
 
 
735 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.01 
 
 
704 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.62 
 
 
804 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.62 
 
 
804 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  28.07 
 
 
729 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  30.3 
 
 
720 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 
731 aa  114  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  22.78 
 
 
756 aa  113  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  27.86 
 
 
711 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25.49 
 
 
756 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  25.51 
 
 
743 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  24.1 
 
 
872 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  27.02 
 
 
709 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  24.46 
 
 
466 aa  106  9e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1457  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.46 
 
 
576 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  27.3 
 
 
789 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 
467 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  24.83 
 
 
737 aa  104  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.95 
 
 
770 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  27.96 
 
 
466 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.23 
 
 
755 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  26.32 
 
 
472 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.96 
 
 
776 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  24.94 
 
 
726 aa  99.8  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.75 
 
 
737 aa  99.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  25.05 
 
 
472 aa  98.2  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.81 
 
 
785 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 
731 aa  97.1  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  25.62 
 
 
771 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  25.62 
 
 
789 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.79 
 
 
739 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 
738 aa  95.1  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  25.21 
 
 
797 aa  94.7  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0359  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  26.83 
 
 
720 aa  91.3  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.302004  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0181  non-specific protein-tyrosine kinase  26.05 
 
 
731 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  28.67 
 
 
478 aa  89  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  24.95 
 
 
727 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  24.06 
 
 
461 aa  86.7  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  21.5 
 
 
753 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  22.14 
 
 
721 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  23.13 
 
 
772 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  27.25 
 
 
475 aa  84.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0768542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>