163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5214 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  54.92 
 
 		 804 aa  707    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  57.49 
 
 		 766 aa  757    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 774 aa  1511    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  55.04 
 
 		 804 aa  708    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  54.14 
 
 		 737 aa  696    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  76.05 
 
 		 759 aa  921    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  42.77 
 
 		 713 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  42.35 
 
 		 715 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  40.45 
 
 		 773 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  39.49 
 
 		 769 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  42.23 
 
 		 742 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  40.2 
 
 		 784 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  45.58 
 
 		 763 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  34.63 
 
 		 709 aa  306  7e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  33.87 
 
 		 735 aa  304  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  31.94 
 
 		 747 aa  295  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  35.13 
 
 		 720 aa  291  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.48 
 
 		 726 aa  284  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.02 
 
 		 724 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  34.16 
 
 		 738 aa  251  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  30.74 
 
 		 734 aa  183  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  29.58 
 
 		 756 aa  168  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  27.48 
 
 		 758 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  27.83 
 
 		 737 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.74 
 
 		 739 aa  147  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  26.84 
 
 		 758 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.38 
 
 		 701 aa  145  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  27.17 
 
 		 756 aa  140  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.79 
 
 		 491 aa  140  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  26.31 
 
 		 753 aa  137  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  24.4 
 
 		 756 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  29.03 
 
 		 750 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.55 
 
 		 745 aa  135  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.68 
 
 		 704 aa  134  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  27.61 
 
 		 772 aa  133  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.99 
 
 		 764 aa  132  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.34 
 
 		 748 aa  131  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  25.63 
 
 		 688 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  27.11 
 
 		 782 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.43 
 
 		 755 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.35 
 
 		 778 aa  119  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  28.07 
 
 		 729 aa  118  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  26.85 
 
 		 687 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.17 
 
 		 731 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  25.87 
 
 		 790 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  28 
 
 		 710 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  27.29 
 
 		 788 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.13 
 
 		 696 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  22.56 
 
 		 726 aa  110  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  27.15 
 
 		 764 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  25.42 
 
 		 711 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 731 aa  109  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 		 751 aa  106  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.91 
 
 		 478 aa  103  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  24.42 
 
 		 771 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  24.17 
 
 		 738 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.57 
 
 		 779 aa  103  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  23.19 
 
 		 872 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  24.42 
 
 		 789 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  25.92 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.92 
 
 		 759 aa  101  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  23.97 
 
 		 770 aa  100  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  25.06 
 
 		 776 aa  100  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  23.27 
 
 		 789 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  22.71 
 
 		 753 aa  99.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.99 
 
 		 718 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  22.45 
 
 		 797 aa  98.2  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0359  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  27.96 
 
 		 720 aa  97.4  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.302004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.89 
 
 		 743 aa  95.5  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.34 
 
 		 779 aa  95.1  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 		 707 aa  95.1  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  22.3 
 
 		 772 aa  94.4  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 		 707 aa  94  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  25.63 
 
 		 475 aa  93.2  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 595 aa  92.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.04 
 
 		 776 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2874  lipopolysaccharide biosynthesis  25.11 
 
 		 515 aa  90.9  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  24.35 
 
 		 461 aa  90.9  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  21.31 
 
 		 730 aa  90.1  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6092  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.28 
 
 		 730 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666238  decreased coverage  0.00184203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.26 
 
 		 750 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  25.75 
 
 		 572 aa  89.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  25.12 
 
 		 466 aa  90.1  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  25.75 
 
 		 572 aa  89.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  22.81 
 
 		 472 aa  89.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0387  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 		 509 aa  88.2  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6014  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.56 
 
 		 737 aa  86.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 		 785 aa  85.5  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25.33 
 
 		 756 aa  85.1  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4353  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 		 537 aa  84.7  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201059  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 749 aa  84.3  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  25.47 
 
 		 737 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  26.48 
 
 		 733 aa  82  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.64 
 
 		 491 aa  81.6  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  22.97 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 548 aa  79.7  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0181  non-specific protein-tyrosine kinase  28.28 
 
 		 731 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  22.78 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4497  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 		 734 aa  77.8  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.904654  normal  0.335117 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>