More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2025 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 
469 aa  942    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  45.78 
 
 
472 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  44.42 
 
 
461 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  40.6 
 
 
472 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  39.64 
 
 
466 aa  350  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  38.1 
 
 
475 aa  349  5e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0243  lipopolysaccharide biosynthesis  41.41 
 
 
463 aa  345  8.999999999999999e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  37.44 
 
 
478 aa  320  5e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1376  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.73 
 
 
465 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 
730 aa  156  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.17 
 
 
779 aa  150  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 
737 aa  149  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  26.46 
 
 
755 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  24.54 
 
 
756 aa  144  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  23.94 
 
 
756 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 
731 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  23.19 
 
 
721 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  24.69 
 
 
727 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  23.48 
 
 
711 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  24.17 
 
 
737 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  25 
 
 
788 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  23.53 
 
 
734 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  22.15 
 
 
708 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  22.84 
 
 
872 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  22.08 
 
 
745 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  24.1 
 
 
466 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  25.82 
 
 
733 aa  127  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  24.18 
 
 
753 aa  124  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 
745 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 
738 aa  120  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  23.43 
 
 
472 aa  118  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  22.11 
 
 
770 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  22.32 
 
 
743 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  23.87 
 
 
726 aa  114  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.98 
 
 
739 aa  113  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  25 
 
 
772 aa  113  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  24.58 
 
 
487 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  24.85 
 
 
736 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.02 
 
 
764 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  25.62 
 
 
797 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
724 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  21.77 
 
 
738 aa  107  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  23.4 
 
 
756 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  21.49 
 
 
790 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  22.65 
 
 
747 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.95 
 
 
642 aa  104  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 
463 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 
726 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.6 
 
 
701 aa  103  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
643 aa  103  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  23.06 
 
 
753 aa  99  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.68 
 
 
722 aa  99.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0587  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.74 
 
 
710 aa  97.8  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 
731 aa  97.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  21.72 
 
 
756 aa  97.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  22.37 
 
 
710 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  22.11 
 
 
758 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  22.24 
 
 
806 aa  94.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  22.44 
 
 
778 aa  94.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.95 
 
 
724 aa  94  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  23.8 
 
 
727 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  20.93 
 
 
734 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  24.48 
 
 
709 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.31 
 
 
474 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  19.92 
 
 
772 aa  92.8  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  21.47 
 
 
758 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.96 
 
 
779 aa  92  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.59 
 
 
739 aa  92  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 
737 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1984  polysaccharide chain length determinant protein, putative  23.38 
 
 
490 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.7 
 
 
491 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 
748 aa  89  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  21.94 
 
 
499 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 
804 aa  88.2  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  20.38 
 
 
750 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  22.94 
 
 
715 aa  87.4  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  21.97 
 
 
776 aa  87  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 
776 aa  87  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  23.9 
 
 
782 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  23.96 
 
 
499 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  21.43 
 
 
742 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.3 
 
 
696 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  22.26 
 
 
790 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3175  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.83 
 
 
710 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.659876  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  24.38 
 
 
729 aa  84.7  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3557  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.43 
 
 
710 aa  84  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  21.08 
 
 
735 aa  84  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  22.12 
 
 
713 aa  83.6  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.53 
 
 
477 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3070  lipopolysaccharide biosynthesis  22.69 
 
 
500 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  23.37 
 
 
789 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  23.54 
 
 
764 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 
704 aa  81.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  23.7 
 
 
726 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.7 
 
 
726 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.7 
 
 
726 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.7 
 
 
726 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.7 
 
 
726 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.02 
 
 
720 aa  81.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>