170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0387 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0387  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
509 aa  1018    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4353  lipopolysaccharide biosynthesis protein  43.07 
 
 
537 aa  355  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201059  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2874  lipopolysaccharide biosynthesis  41.61 
 
 
515 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.01 
 
 
478 aa  225  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.57 
 
 
491 aa  223  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.99 
 
 
491 aa  217  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  35.45 
 
 
764 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.37 
 
 
707 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.37 
 
 
707 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.44 
 
 
701 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.41 
 
 
696 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.85 
 
 
595 aa  183  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  30.04 
 
 
756 aa  180  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.41 
 
 
537 aa  170  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  28.7 
 
 
572 aa  169  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.24 
 
 
548 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  28.7 
 
 
572 aa  168  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  29.21 
 
 
687 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  29.37 
 
 
688 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.49 
 
 
745 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  28.33 
 
 
788 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  27.35 
 
 
753 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  26.38 
 
 
758 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  26 
 
 
756 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 
748 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  27 
 
 
782 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  25.59 
 
 
758 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  28.76 
 
 
734 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  28.54 
 
 
778 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6014  exopolysaccharide polymerization/transport protein  28.12 
 
 
737 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807866  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  27.29 
 
 
772 aa  121  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  24.17 
 
 
738 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  27.63 
 
 
710 aa  118  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.57 
 
 
779 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.79 
 
 
718 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.81 
 
 
751 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  27.13 
 
 
750 aa  117  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.48 
 
 
704 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  25.29 
 
 
776 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  26.37 
 
 
747 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.17 
 
 
739 aa  114  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.22 
 
 
764 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 
750 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 
759 aa  110  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 
726 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  22.51 
 
 
755 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
724 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  28.85 
 
 
789 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.64 
 
 
738 aa  105  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  27.5 
 
 
709 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  27.44 
 
 
789 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  27.44 
 
 
771 aa  100  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.68 
 
 
770 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  26.1 
 
 
729 aa  95.9  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  26.09 
 
 
763 aa  93.6  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  23.25 
 
 
790 aa  93.2  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  24.87 
 
 
715 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 
784 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  25.77 
 
 
742 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.31 
 
 
774 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 
731 aa  91.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  23.01 
 
 
743 aa  91.3  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  24.08 
 
 
735 aa  90.1  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 
730 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.06 
 
 
737 aa  88.6  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  24 
 
 
720 aa  87.4  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  24.44 
 
 
713 aa  87.4  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 
766 aa  87  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 
776 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  20.84 
 
 
756 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 
759 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  22.76 
 
 
753 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  25.65 
 
 
472 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  26.95 
 
 
472 aa  81.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6092  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 
730 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666238  decreased coverage  0.00184203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  24.44 
 
 
769 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  23.59 
 
 
461 aa  80.1  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 
737 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 
804 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  22.77 
 
 
756 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 
804 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  24.79 
 
 
466 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  23.38 
 
 
872 aa  77  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0359  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  25.23 
 
 
720 aa  76.6  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.302004  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2364  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.01 
 
 
507 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  21.83 
 
 
721 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.16 
 
 
779 aa  73.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  19.07 
 
 
734 aa  73.9  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0181  non-specific protein-tyrosine kinase  24.88 
 
 
731 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0861  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.16 
 
 
536 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 
785 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  23.06 
 
 
737 aa  70.9  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0282  polysaccharide chain length determinant protein  22.25 
 
 
511 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  24.6 
 
 
745 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  20.41 
 
 
797 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  22.91 
 
 
772 aa  68.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  22.55 
 
 
774 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  22.74 
 
 
466 aa  67.4  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
467 aa  67.4  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>