193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2505 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  100 
 
 
735 aa  1474    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  46.58 
 
 
720 aa  591  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  40.24 
 
 
747 aa  498  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  40.6 
 
 
709 aa  491  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  40.41 
 
 
726 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  40.85 
 
 
724 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  35.44 
 
 
773 aa  353  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  35.29 
 
 
769 aa  339  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  41.3 
 
 
715 aa  334  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  42.22 
 
 
713 aa  334  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  41.76 
 
 
763 aa  325  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.01 
 
 
784 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.87 
 
 
774 aa  297  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0785  hypothetical protein  69.73 
 
 
220 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.18 
 
 
766 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0778  hypothetical protein  69.19 
 
 
220 aa  272  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.11 
 
 
737 aa  267  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.51 
 
 
759 aa  251  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.85 
 
 
804 aa  237  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.85 
 
 
804 aa  237  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  29.9 
 
 
738 aa  235  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.48 
 
 
734 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  26.19 
 
 
756 aa  174  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  24.72 
 
 
788 aa  149  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.21 
 
 
778 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.79 
 
 
701 aa  147  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  26.78 
 
 
758 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.97 
 
 
748 aa  144  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  27.21 
 
 
758 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.96 
 
 
745 aa  139  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  26.41 
 
 
797 aa  137  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  26.06 
 
 
782 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  22.71 
 
 
743 aa  134  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.98 
 
 
751 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  22.09 
 
 
756 aa  132  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.56 
 
 
491 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  24.85 
 
 
753 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 
737 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  26.17 
 
 
710 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 
764 aa  127  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  25.9 
 
 
753 aa  124  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.43 
 
 
739 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  20.98 
 
 
756 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.06 
 
 
755 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  23.62 
 
 
772 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  24.88 
 
 
772 aa  118  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.65 
 
 
537 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  26.65 
 
 
688 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  24.16 
 
 
737 aa  115  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 
548 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  23.32 
 
 
750 aa  114  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  20 
 
 
708 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  27.13 
 
 
711 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.69 
 
 
595 aa  111  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  25.62 
 
 
776 aa  109  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  25.34 
 
 
687 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0181  non-specific protein-tyrosine kinase  28.67 
 
 
731 aa  108  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 
731 aa  108  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  20.37 
 
 
756 aa  105  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 
718 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.98 
 
 
696 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 
750 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 
759 aa  101  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 
704 aa  99.8  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  21.31 
 
 
726 aa  99.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  21.71 
 
 
721 aa  99.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  24.35 
 
 
764 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  25.43 
 
 
466 aa  96.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  23.48 
 
 
790 aa  96.3  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6014  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.31 
 
 
737 aa  95.1  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807866  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4353  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 
537 aa  95.1  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201059  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 
738 aa  94.4  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  22.55 
 
 
872 aa  94.4  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  26.7 
 
 
572 aa  92.8  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  26.7 
 
 
572 aa  92.4  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.09 
 
 
730 aa  91.7  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.49 
 
 
779 aa  91.3  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  26.34 
 
 
770 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6092  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.55 
 
 
730 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666238  decreased coverage  0.00184203 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 
467 aa  90.1  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.05 
 
 
776 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  23.72 
 
 
733 aa  89.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  25.21 
 
 
727 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.45 
 
 
478 aa  89  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  26.42 
 
 
729 aa  88.6  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  23.96 
 
 
466 aa  87.8  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  23.69 
 
 
789 aa  87  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 
785 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0387  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 
509 aa  86.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  25.34 
 
 
774 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  22.39 
 
 
469 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  22.03 
 
 
779 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  23.17 
 
 
472 aa  85.5  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 
731 aa  84.7  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  21.14 
 
 
804 aa  84.7  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 
749 aa  84  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  23.08 
 
 
472 aa  82.4  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  24.1 
 
 
771 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  23.48 
 
 
789 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 
491 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>