151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0308 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  56.1 
 
 
766 aa  739    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  54.09 
 
 
774 aa  667    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  55.99 
 
 
804 aa  729    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
737 aa  1440    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  56.45 
 
 
804 aa  731    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  67.02 
 
 
759 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  40.15 
 
 
769 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  37.98 
 
 
715 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  38.46 
 
 
773 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  38.57 
 
 
742 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  38.53 
 
 
713 aa  389  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.4 
 
 
784 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  43.89 
 
 
763 aa  362  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.31 
 
 
726 aa  310  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.05 
 
 
724 aa  294  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  34.53 
 
 
709 aa  284  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  31.33 
 
 
747 aa  273  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  34.86 
 
 
720 aa  272  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  30.91 
 
 
735 aa  254  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  31.04 
 
 
738 aa  226  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  28.96 
 
 
756 aa  157  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  28.91 
 
 
734 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 
737 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  24.9 
 
 
756 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.58 
 
 
739 aa  137  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.52 
 
 
755 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 
748 aa  134  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.95 
 
 
745 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  26.22 
 
 
758 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  26.81 
 
 
758 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  27.14 
 
 
788 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.32 
 
 
701 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  25.54 
 
 
772 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.47 
 
 
491 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  24.22 
 
 
688 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  24.97 
 
 
750 aa  120  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  25.57 
 
 
756 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.32 
 
 
778 aa  117  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.51 
 
 
764 aa  115  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  27.35 
 
 
764 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  27.98 
 
 
461 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 
731 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  24.84 
 
 
872 aa  112  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.65 
 
 
704 aa  111  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  25.61 
 
 
710 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  25.67 
 
 
753 aa  108  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  26.11 
 
 
711 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  25.84 
 
 
770 aa  107  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  25.42 
 
 
687 aa  107  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.52 
 
 
779 aa  107  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 
478 aa  106  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  22.46 
 
 
726 aa  105  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  24.95 
 
 
782 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 
738 aa  102  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 
696 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  29.14 
 
 
475 aa  102  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 
759 aa  100  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.56 
 
 
743 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 
467 aa  99.4  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.68 
 
 
779 aa  98.6  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6014  exopolysaccharide polymerization/transport protein  26.15 
 
 
737 aa  98.2  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807866  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  27.07 
 
 
729 aa  97.8  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  23.51 
 
 
472 aa  97.8  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 
707 aa  97.8  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  24.02 
 
 
737 aa  97.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 
707 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 
730 aa  95.1  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  24.03 
 
 
466 aa  95.1  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.24 
 
 
731 aa  94.7  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.72 
 
 
751 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  26.15 
 
 
572 aa  90.9  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2874  lipopolysaccharide biosynthesis  24.35 
 
 
515 aa  90.5  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.56 
 
 
595 aa  90.5  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  26.15 
 
 
572 aa  89.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  22.22 
 
 
772 aa  89  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.05 
 
 
491 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  20.88 
 
 
753 aa  87.8  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  24.18 
 
 
790 aa  85.9  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.08 
 
 
718 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 
776 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6092  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.76 
 
 
730 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666238  decreased coverage  0.00184203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  26.91 
 
 
776 aa  84.3  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  22.57 
 
 
797 aa  83.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  22.96 
 
 
478 aa  83.2  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  26.3 
 
 
733 aa  83.2  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4497  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 
734 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.904654  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4129  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 
734 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4611  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.47 
 
 
743 aa  81.6  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4353  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 
537 aa  81.3  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201059  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  24.21 
 
 
469 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  22.98 
 
 
789 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0359  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  27.81 
 
 
720 aa  78.6  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.302004  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  23.48 
 
 
472 aa  78.2  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 
750 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  24.09 
 
 
774 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  23.72 
 
 
771 aa  75.5  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  23.72 
 
 
789 aa  75.5  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0587  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 
710 aa  74.3  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  24.65 
 
 
466 aa  73.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 
785 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>