244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2364 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2364  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 507 aa  1018    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  51.7 
 
 		 499 aa  522  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1984  polysaccharide chain length determinant protein, putative  54.2 
 
 		 490 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1770  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  51.76 
 
 		 499 aa  488  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  53.09 
 
 		 499 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  40.93 
 
 		 518 aa  392  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2221  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  39.19 
 
 		 489 aa  331  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120089  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3070  lipopolysaccharide biosynthesis  36.3 
 
 		 500 aa  312  9e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0831  chain length determinant family protein  39.64 
 
 		 502 aa  306  6e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0688  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  37.73 
 
 		 480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  24.62 
 
 		 514 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2528  lipopolysaccharide biosynthesis  25.52 
 
 		 510 aa  150  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.597062  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0659  lipopolysaccharide biosynthesis  23.64 
 
 		 524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2391  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.64 
 
 		 530 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3508  polysaccharide chain length determinant protein  21.74 
 
 		 517 aa  143  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047598 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0282  polysaccharide chain length determinant protein  22.64 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2398  lipopolysaccharide biosynthesis  25.7 
 
 		 480 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0820285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1169  lipopolysaccharide biosynthesis  22.02 
 
 		 527 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1984  lipopolysaccharide biosynthesis  23.45 
 
 		 533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1446  lipopolysaccharide biosynthesis  23.98 
 
 		 519 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5026  chain length determinant family protein  24.5 
 
 		 528 aa  130  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2506  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.84 
 
 		 518 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.882544 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02600  chain length determinant family protein  23.74 
 
 		 519 aa  124  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.283305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2580  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1659  lipopolysaccharide biosynthesis  22.65 
 
 		 505 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.490085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0133  hypothetical protein  21.91 
 
 		 507 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2918  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.9 
 
 		 522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732193  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0147  lipopolysaccharide biosynthesis  21.81 
 
 		 503 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3127  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 		 512 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2588  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 		 520 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  25.5 
 
 		 806 aa  109  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2728  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.22 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898945  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 804 aa  108  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2964  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  26.38 
 
 		 790 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  25.13 
 
 		 779 aa  103  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1507  lipopolysaccharide biosynthesis  20.04 
 
 		 510 aa  103  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.577803  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 		 474 aa  99.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3118  lipopolysaccharide biosynthesis  22.37 
 
 		 532 aa  98.6  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0491036  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1521  lipopolysaccharide biosynthesis  21.14 
 
 		 514 aa  97.1  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  25.52 
 
 		 736 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4239  lipopolysaccharide biosynthesis  21.62 
 
 		 517 aa  89.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0553335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2616  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 		 455 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.162079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  23.59 
 
 		 487 aa  87.8  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.96 
 
 		 575 aa  87  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  23.64 
 
 		 509 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3388  polysaccharide chain length determinant protein  19.79 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2335  lipopolysaccharide biosynthesis  23.87 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.69 
 
 		 720 aa  85.5  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  21.86 
 
 		 872 aa  84.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0427  uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis-like protein  20.86 
 
 		 521 aa  82.8  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0403226 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 		 731 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4786  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 519 aa  81.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  24.95 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  21.3 
 
 		 756 aa  80.1  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  23.82 
 
 		 757 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 463 aa  79.7  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  24.4 
 
 		 726 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  19.39 
 
 		 750 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  22.09 
 
 		 741 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  20.94 
 
 		 710 aa  77.4  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  23.15 
 
 		 738 aa  76.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  22.17 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0298  hypothetical protein  19.32 
 
 		 499 aa  75.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  20.43 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  19.34 
 
 		 743 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  19.65 
 
 		 475 aa  75.1  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  23.7 
 
 		 750 aa  75.1  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4032  PEP-CTERM locus polysaccharide chain length determinant  19.55 
 
 		 507 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077437  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  23 
 
 		 770 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  19.84 
 
 		 772 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  21.26 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  21.01 
 
 		 734 aa  70.5  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.54 
 
 		 737 aa  70.5  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2831  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.99 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370542  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.04 
 
 		 643 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  20.2 
 
 		 719 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  19.95 
 
 		 719 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  20.72 
 
 		 456 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.618609  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  19.95 
 
 		 719 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  22.86 
 
 		 734 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  20.09 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  19.95 
 
 		 719 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0585  lipopolysaccharide biosynthesis  21.41 
 
 		 537 aa  69.3  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976376 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  22.84 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2407  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.04 
 
 		 601 aa  68.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.3542 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  20.16 
 
 		 756 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.62 
 
 		 642 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  19.7 
 
 		 719 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 477 aa  67  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  19.95 
 
 		 720 aa  66.6  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  21.64 
 
 		 733 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  19.94 
 
 		 758 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  19.65 
 
 		 720 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.77 
 
 		 741 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.86 
 
 		 736 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  22.77 
 
 		 741 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  21.38 
 
 		 753 aa  62.4  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  18.77 
 
 		 724 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  21.25 
 
 		 741 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>