226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0831 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0831  chain length determinant family protein  100 
 
 		 502 aa  1009    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3070  lipopolysaccharide biosynthesis  48.88 
 
 		 500 aa  425  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0688  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  50.35 
 
 		 480 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2364  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.64 
 
 		 507 aa  339  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  39.75 
 
 		 499 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1770  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  38.45 
 
 		 499 aa  335  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2221  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  42.33 
 
 		 489 aa  335  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  37.76 
 
 		 499 aa  326  8.000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1984  polysaccharide chain length determinant protein, putative  40 
 
 		 490 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  31.4 
 
 		 518 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  26.88 
 
 		 514 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2506  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  27.93 
 
 		 518 aa  144  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.882544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2528  lipopolysaccharide biosynthesis  25.41 
 
 		 510 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.597062  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1984  lipopolysaccharide biosynthesis  24.24 
 
 		 533 aa  137  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2391  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 		 530 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0282  polysaccharide chain length determinant protein  24.65 
 
 		 511 aa  134  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0147  lipopolysaccharide biosynthesis  23.97 
 
 		 503 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5026  chain length determinant family protein  23.43 
 
 		 528 aa  128  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1169  lipopolysaccharide biosynthesis  24.56 
 
 		 527 aa  126  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0659  lipopolysaccharide biosynthesis  25.94 
 
 		 524 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413741  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02600  chain length determinant family protein  23.82 
 
 		 519 aa  118  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.283305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2580  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.52 
 
 		 520 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3508  polysaccharide chain length determinant protein  25.65 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047598 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1507  lipopolysaccharide biosynthesis  22.54 
 
 		 510 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.577803  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2964  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 493 aa  113  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2398  lipopolysaccharide biosynthesis  26.13 
 
 		 480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0820285  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3127  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 512 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1659  lipopolysaccharide biosynthesis  24.1 
 
 		 505 aa  111  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.490085  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2918  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 		 522 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732193  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2728  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 520 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898945  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1446  lipopolysaccharide biosynthesis  23.66 
 
 		 519 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0133  hypothetical protein  24.27 
 
 		 507 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3118  lipopolysaccharide biosynthesis  26.27 
 
 		 532 aa  108  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0491036  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2588  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.31 
 
 		 520 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  25.52 
 
 		 790 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1521  lipopolysaccharide biosynthesis  21.48 
 
 		 514 aa  104  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  25.15 
 
 		 806 aa  102  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 463 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.42 
 
 		 804 aa  93.2  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 474 aa  91.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4239  lipopolysaccharide biosynthesis  25.42 
 
 		 517 aa  82  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0553335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  23.45 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0427  uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis-like protein  20.09 
 
 		 521 aa  79.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0403226 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  24.71 
 
 		 820 aa  73.9  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  22.18 
 
 		 734 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2407  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 		 601 aa  71.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.3542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3388  polysaccharide chain length determinant protein  21.51 
 
 		 508 aa  70.5  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  21.36 
 
 		 872 aa  70.1  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  23.46 
 
 		 741 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  23.88 
 
 		 739 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  23.04 
 
 		 756 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  22.33 
 
 		 723 aa  67.4  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  25.24 
 
 		 741 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  23.89 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 		 643 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  25.61 
 
 		 779 aa  64.3  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  25.75 
 
 		 740 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  20.36 
 
 		 750 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 		 575 aa  64.3  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  27 
 
 		 755 aa  64.3  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  25.48 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  22.02 
 
 		 743 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  24.1 
 
 		 734 aa  63.9  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  23.31 
 
 		 739 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  20.83 
 
 		 736 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  23.81 
 
 		 739 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  23.31 
 
 		 739 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  23.25 
 
 		 723 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 642 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  21.41 
 
 		 724 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  23.08 
 
 		 744 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  22.82 
 
 		 772 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  23.08 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  22.69 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.1 
 
 		 722 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  22.01 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4032  PEP-CTERM locus polysaccharide chain length determinant  24.72 
 
 		 507 aa  61.2  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077437  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0846  lipopolysaccharide biosynthesis  20.5 
 
 		 488 aa  60.5  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 653 aa  60.1  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  22.36 
 
 		 747 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  22.47 
 
 		 466 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0298  hypothetical protein  21.09 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0585  lipopolysaccharide biosynthesis  22.38 
 
 		 537 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  22.92 
 
 		 738 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2335  lipopolysaccharide biosynthesis  22.76 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  23.14 
 
 		 710 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  23.12 
 
 		 727 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4786  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.94 
 
 		 519 aa  58.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  24.48 
 
 		 746 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  22.12 
 
 		 719 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  21.79 
 
 		 719 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  21.79 
 
 		 719 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  21.79 
 
 		 719 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  21.79 
 
 		 719 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  22.67 
 
 		 757 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  24.39 
 
 		 746 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  24.01 
 
 		 735 aa  57  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  20.51 
 
 		 720 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  21.01 
 
 		 726 aa  56.6  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  19.58 
 
 		 722 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>