104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4239 on replicon NC_007801
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007801  Jann_4239  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 517 aa  1023    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0553335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3388  polysaccharide chain length determinant protein  41.31 
 
 		 508 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4786  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.79 
 
 		 519 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2918  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.58 
 
 		 522 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732193  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2728  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.15 
 
 		 520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898945  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2588  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.53 
 
 		 520 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3127  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.38 
 
 		 512 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0846  lipopolysaccharide biosynthesis  26.17 
 
 		 488 aa  147  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.47 
 
 		 499 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1770  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  21.83 
 
 		 499 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2580  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1015  hypothetical protein  26.28 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1169  lipopolysaccharide biosynthesis  21.6 
 
 		 527 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2407  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 		 601 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.3542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2364  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.62 
 
 		 507 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0147  lipopolysaccharide biosynthesis  25.18 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1446  lipopolysaccharide biosynthesis  21.36 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 575 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2506  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  24.44 
 
 		 518 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.882544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  21.26 
 
 		 499 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2391  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 530 aa  98.2  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  21.41 
 
 		 518 aa  97.8  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1984  polysaccharide chain length determinant protein, putative  22.24 
 
 		 490 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0282  polysaccharide chain length determinant protein  21.97 
 
 		 511 aa  86.7  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2964  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5026  chain length determinant family protein  21.38 
 
 		 528 aa  83.6  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1984  lipopolysaccharide biosynthesis  20.09 
 
 		 533 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2409  lipopolysaccharide biosynthesis  22.82 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2616  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.162079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1521  lipopolysaccharide biosynthesis  23.04 
 
 		 514 aa  81.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0831  chain length determinant family protein  25.48 
 
 		 502 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2221  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  21.36 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120089  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3070  lipopolysaccharide biosynthesis  19.4 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3118  lipopolysaccharide biosynthesis  22.46 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0491036  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4032  PEP-CTERM locus polysaccharide chain length determinant  22.13 
 
 		 507 aa  70.1  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077437  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1659  lipopolysaccharide biosynthesis  22.86 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.490085  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1507  lipopolysaccharide biosynthesis  22.97 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.577803  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  21.5 
 
 		 514 aa  68.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0298  hypothetical protein  23.66 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  26.63 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2528  lipopolysaccharide biosynthesis  20.22 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.597062  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  23.77 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  22.74 
 
 		 806 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  22.31 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  22.38 
 
 		 727 aa  58.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.15 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  18.93 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3508  polysaccharide chain length determinant protein  22.25 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047598 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2335  lipopolysaccharide biosynthesis  23.08 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  19.43 
 
 		 756 aa  55.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  23.5 
 
 		 790 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2831  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 456 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370542  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.11 
 
 		 653 aa  54.7  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  22.19 
 
 		 711 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.39 
 
 		 464 aa  53.9  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0585  lipopolysaccharide biosynthesis  22.2 
 
 		 537 aa  53.9  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976376 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0659  lipopolysaccharide biosynthesis  19.59 
 
 		 524 aa  53.9  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413741  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  25.51 
 
 		 734 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  22.18 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  19.92 
 
 		 753 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02221  hypothetical protein  21.68 
 
 		 475 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  22.14 
 
 		 772 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  22.63 
 
 		 478 aa  50.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  20.75 
 
 		 487 aa  50.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003540  chain length determinant protein  21.04 
 
 		 457 aa  50.4  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2398  lipopolysaccharide biosynthesis  19.64 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0820285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  20.71 
 
 		 742 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1069  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.5 
 
 		 230 aa  49.3  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.62909  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 643 aa  49.3  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  21.84 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  23.05 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2736  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00743206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  24.09 
 
 		 721 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2448  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.24 
 
 		 219 aa  48.5  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0667575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  19.02 
 
 		 750 aa  48.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  20.85 
 
 		 804 aa  47.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  24.83 
 
 		 456 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.618609  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0688  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  19.67 
 
 		 480 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403997 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6432  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 734 aa  47.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.402351 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 		 642 aa  47  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  19.77 
 
 		 778 aa  47  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  21.49 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0659  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.03 
 
 		 671 aa  46.6  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  21.02 
 
 		 738 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1844  uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis  24.12 
 
 		 773 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  24.32 
 
 		 726 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3692  lipopolysaccharide biosynthesis  23.24 
 
 		 736 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.306041 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12760  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.44 
 
 		 223 aa  46.2  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.392937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1173  cpsC protein  24 
 
 		 230 aa  45.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  19.48 
 
 		 872 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 776 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  19.32 
 
 		 788 aa  44.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 		 731 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.42 
 
 		 745 aa  44.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  24.13 
 
 		 726 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  24 
 
 		 727 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0133  hypothetical protein  20.65 
 
 		 507 aa  44.3  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  20.85 
 
 		 756 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  22.91 
 
 		 731 aa  43.9  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2652  lipopolysaccharide biosynthesis  27.17 
 
 		 222 aa  43.9  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>