112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003540 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003540  chain length determinant protein  100 
 
 		 457 aa  925    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02221  hypothetical protein  85.49 
 
 		 475 aa  773    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0298  hypothetical protein  57.21 
 
 		 499 aa  513  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0282  polysaccharide chain length determinant protein  22.03 
 
 		 511 aa  110  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1659  lipopolysaccharide biosynthesis  24.89 
 
 		 505 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.490085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1169  lipopolysaccharide biosynthesis  24.16 
 
 		 527 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5026  chain length determinant family protein  23.44 
 
 		 528 aa  99.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2506  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.92 
 
 		 518 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.882544 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2391  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 530 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2528  lipopolysaccharide biosynthesis  21.72 
 
 		 510 aa  91.3  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.597062  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.99 
 
 		 514 aa  87  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3388  polysaccharide chain length determinant protein  23.93 
 
 		 508 aa  83.6  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0133  hypothetical protein  23.58 
 
 		 507 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  20.97 
 
 		 499 aa  77.4  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1984  polysaccharide chain length determinant protein, putative  20.18 
 
 		 490 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 804 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  18.54 
 
 		 518 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2580  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  19.65 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 653 aa  73.6  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1521  lipopolysaccharide biosynthesis  21.7 
 
 		 514 aa  73.2  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2364  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.09 
 
 		 507 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.46 
 
 		 778 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02600  chain length determinant family protein  21.05 
 
 		 519 aa  70.5  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.283305  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2221  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  21.51 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1446  lipopolysaccharide biosynthesis  20.95 
 
 		 519 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2964  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.1 
 
 		 493 aa  66.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2398  lipopolysaccharide biosynthesis  22.96 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0820285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.22 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0147  lipopolysaccharide biosynthesis  22.2 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3118  lipopolysaccharide biosynthesis  23.16 
 
 		 532 aa  63.9  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0491036  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0659  lipopolysaccharide biosynthesis  23.82 
 
 		 524 aa  63.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  31.16 
 
 		 721 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1770  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  20.47 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  22.19 
 
 		 872 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1984  lipopolysaccharide biosynthesis  21.23 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 		 643 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.93 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  22.37 
 
 		 750 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3508  polysaccharide chain length determinant protein  19.78 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047598 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2335  lipopolysaccharide biosynthesis  21.14 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  20.05 
 
 		 737 aa  57.4  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  18.33 
 
 		 790 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  26.76 
 
 		 743 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  22.42 
 
 		 756 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  21.73 
 
 		 770 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  24.78 
 
 		 727 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 		 575 aa  54.3  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 		 738 aa  53.9  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  21.99 
 
 		 736 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  23.72 
 
 		 487 aa  53.5  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  20.29 
 
 		 756 aa  53.5  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 463 aa  53.1  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  21.81 
 
 		 753 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3127  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.13 
 
 		 512 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  19.89 
 
 		 806 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  22.33 
 
 		 741 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2588  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 520 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4516  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 		 740 aa  50.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265427  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0659  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 671 aa  50.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  23.29 
 
 		 756 aa  50.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  27.94 
 
 		 726 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.94 
 
 		 726 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.44 
 
 		 720 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.94 
 
 		 726 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  24.23 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.94 
 
 		 726 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  31.88 
 
 		 232 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  31.88 
 
 		 232 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0427  uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis-like protein  21.56 
 
 		 521 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0403226 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.94 
 
 		 726 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.94 
 
 		 726 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  22.29 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  27.94 
 
 		 726 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.94 
 
 		 726 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  22.78 
 
 		 684 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  21.77 
 
 		 767 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2918  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.17 
 
 		 522 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732193  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.1 
 
 		 467 aa  47.8  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  25.19 
 
 		 509 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3070  lipopolysaccharide biosynthesis  22.42 
 
 		 500 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  23.18 
 
 		 743 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  21.13 
 
 		 750 aa  47  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 		 745 aa  47  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4239  lipopolysaccharide biosynthesis  21.04 
 
 		 517 aa  46.6  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0553335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 		 730 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0918  capsule chain length determinant protein  26 
 
 		 237 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000182566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  28.43 
 
 		 745 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.27 
 
 		 722 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  46.15 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2448  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.94 
 
 		 219 aa  45.8  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0667575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  23.16 
 
 		 746 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  17.71 
 
 		 708 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  22.49 
 
 		 790 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  36.76 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4032  PEP-CTERM locus polysaccharide chain length determinant  22.51 
 
 		 507 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077437  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  46.15 
 
 		 247 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  21 
 
 		 782 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  22.41 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  28.57 
 
 		 726 aa  45.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>