154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0918 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0918  capsule chain length determinant protein  100 
 
 		 237 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000182566  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  42.92 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  43.36 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  36.74 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.86 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.62 
 
 		 221 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.85 
 
 		 464 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.38 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  27.52 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  32.97 
 
 		 492 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5553  capsular polysaccharide biosynthesis  27.52 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000105771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5452  chain length regulator  27.52 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4959  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  27.52 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000799386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5074  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3269  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.5 
 
 		 223 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.316861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  26.15 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  25.68 
 
 		 466 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  23.87 
 
 		 508 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1069  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.58 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.62909  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2652  lipopolysaccharide biosynthesis  25.12 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1173  cpsC protein  27.23 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  22.97 
 
 		 505 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0540  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.99 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2688  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2745  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.49 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0135  MPA1 family polysaccharide export protein  28.12 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0140  MPA1 family polysaccharide export protein  28.12 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  23.08 
 
 		 454 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12760  capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.05 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.392937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2448  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0667575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1646  chain length determinant protein  25.79 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  22.6 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1944  lipopolysaccharide biosynthesis  27.4 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1678  chain length determinant protein  27.23 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1491  chain length determinant protein  27.23 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1609  chain length determinant protein  27.23 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1464  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  26.79 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000744364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3699  chain length determinant protein  25.79 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  23.42 
 
 		 497 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  21.33 
 
 		 667 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  42.03 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  22.04 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2856  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.29 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  26.92 
 
 		 750 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1179  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  35.58 
 
 		 730 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1156  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000219434  hitchhiker  4.797860000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  26.39 
 
 		 478 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  27.15 
 
 		 443 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0501  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.16 
 
 		 488 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.056909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  26.92 
 
 		 722 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  18.93 
 
 		 521 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  31.94 
 
 		 487 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  29.09 
 
 		 737 aa  55.5  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  35.29 
 
 		 779 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  24.48 
 
 		 605 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  34 
 
 		 721 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  28.18 
 
 		 475 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  37.31 
 
 		 527 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  18.84 
 
 		 615 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  26.36 
 
 		 624 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.62 
 
 		 726 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  26.62 
 
 		 726 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  19.83 
 
 		 524 aa  53.1  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  26.62 
 
 		 726 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  29.49 
 
 		 711 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.62 
 
 		 726 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.62 
 
 		 726 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.62 
 
 		 726 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.62 
 
 		 726 aa  53.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.62 
 
 		 726 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  31.51 
 
 		 472 aa  52.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  27.38 
 
 		 759 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  27.87 
 
 		 741 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  34.29 
 
 		 472 aa  52  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  34.57 
 
 		 804 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  22.27 
 
 		 484 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  27.78 
 
 		 772 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  24.78 
 
 		 469 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  20.74 
 
 		 747 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  35.29 
 
 		 736 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.47 
 
 		 734 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  29.84 
 
 		 767 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  26.03 
 
 		 756 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2274  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.9 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 		 474 aa  49.3  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  23.96 
 
 		 503 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  24.84 
 
 		 790 aa  49.7  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  27.03 
 
 		 756 aa  48.9  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  27.67 
 
 		 723 aa  48.9  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.1 
 
 		 726 aa  48.5  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  33.77 
 
 		 822 aa  48.5  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  31.43 
 
 		 806 aa  48.5  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  20.94 
 
 		 509 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  23.27 
 
 		 757 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  24.14 
 
 		 872 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  36.76 
 
 		 499 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>