138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1944 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1944  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 
253 aa  498  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  53.56 
 
 
492 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  31.9 
 
 
247 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5553  capsular polysaccharide biosynthesis  32.29 
 
 
247 aa  121  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000105771  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.18 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5452  chain length regulator  31.82 
 
 
247 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  30.04 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5074  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.74 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4959  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  31.22 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000799386  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  30.84 
 
 
232 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  30.13 
 
 
232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.77 
 
 
247 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.39 
 
 
221 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  34.08 
 
 
667 aa  111  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.43 
 
 
464 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  29.44 
 
 
247 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.25 
 
 
227 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0918  capsule chain length determinant protein  27.4 
 
 
237 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000182566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2652  lipopolysaccharide biosynthesis  26.34 
 
 
222 aa  98.6  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.74 
 
 
482 aa  94  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  30.7 
 
 
505 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3269  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.86 
 
 
223 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.316861  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  30.26 
 
 
508 aa  92  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.67 
 
 
480 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  31.28 
 
 
466 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  30.04 
 
 
615 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3104  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.5 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466089  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3667  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.68 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0540  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0501  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.38 
 
 
488 aa  79.3  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.056909  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4007  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.76 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  29.28 
 
 
454 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4043  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.23 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.362631  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000403429  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  31.05 
 
 
490 aa  75.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1179  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  29.09 
 
 
509 aa  75.5  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0135  MPA1 family polysaccharide export protein  24.87 
 
 
222 aa  72  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0140  MPA1 family polysaccharide export protein  24.87 
 
 
222 aa  72  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2374  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  36.04 
 
 
445 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  27.23 
 
 
496 aa  68.9  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  34.91 
 
 
804 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  27.8 
 
 
469 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1173  cpsC protein  25 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  43.06 
 
 
711 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  26.43 
 
 
477 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1069  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.4 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.62909  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  32.13 
 
 
473 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  29.96 
 
 
497 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.5 
 
 
474 aa  62.8  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  30.04 
 
 
521 aa  62  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  26.85 
 
 
529 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  27.51 
 
 
503 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2856  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.67 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1646  chain length determinant protein  23.63 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  39.45 
 
 
750 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  33.68 
 
 
872 aa  60.1  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  36.04 
 
 
624 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2448  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 
219 aa  59.3  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0667575  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  36.52 
 
 
605 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 
524 aa  58.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12760  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.392937  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1464  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  22.22 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000744364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1678  chain length determinant protein  22.22 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  30.81 
 
 
741 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  26.36 
 
 
463 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  45.45 
 
 
730 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2688  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.44 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2745  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.44 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.81 
 
 
741 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  29.82 
 
 
741 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  29.82 
 
 
741 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.82 
 
 
741 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1491  chain length determinant protein  21.78 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1609  chain length determinant protein  21.78 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3699  chain length determinant protein  23.21 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290655  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  28.65 
 
 
741 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  36.71 
 
 
790 aa  55.1  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  39.51 
 
 
736 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.68 
 
 
741 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  32.1 
 
 
763 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  40.87 
 
 
478 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  33.72 
 
 
527 aa  53.5  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  38.27 
 
 
745 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  37.5 
 
 
487 aa  53.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.45 
 
 
730 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  25.71 
 
 
806 aa  52.8  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  27.8 
 
 
438 aa  52.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  26.43 
 
 
474 aa  52  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  42.19 
 
 
721 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  32.99 
 
 
739 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  32.1 
 
 
779 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  28.32 
 
 
732 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  41.03 
 
 
774 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.75 
 
 
575 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  28.51 
 
 
525 aa  50.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  37.31 
 
 
747 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  27.75 
 
 
740 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  36.26 
 
 
741 aa  49.3  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>