More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0501 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0501  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 488 aa  974    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.056909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  60.62 
 
 		 480 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  34.16 
 
 		 605 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  33.11 
 
 		 490 aa  174  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  29.95 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  32.5 
 
 		 505 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  29.41 
 
 		 624 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  30.48 
 
 		 469 aa  156  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  32.43 
 
 		 497 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  30.75 
 
 		 508 aa  153  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.78 
 
 		 575 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  23.83 
 
 		 464 aa  150  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  30.48 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  30.51 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  31.46 
 
 		 463 aa  136  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  32.39 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  31.12 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  29.18 
 
 		 503 aa  126  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  28.29 
 
 		 667 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  33.33 
 
 		 233 aa  117  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  32.39 
 
 		 233 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  28.73 
 
 		 615 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  30.07 
 
 		 525 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  29.16 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  34.9 
 
 		 232 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  31.92 
 
 		 233 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.05 
 
 		 234 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  26.64 
 
 		 529 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  30.21 
 
 		 438 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  28.43 
 
 		 453 aa  114  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  27.11 
 
 		 521 aa  113  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  31.92 
 
 		 233 aa  113  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  31.75 
 
 		 750 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  31.46 
 
 		 233 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  27.7 
 
 		 496 aa  109  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  29.52 
 
 		 741 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  29.51 
 
 		 742 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  29.36 
 
 		 739 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  25.91 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  29.01 
 
 		 804 aa  108  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.3 
 
 		 482 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 		 730 aa  107  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  31.73 
 
 		 722 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  32.11 
 
 		 247 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  30.08 
 
 		 790 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  29.63 
 
 		 473 aa  105  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  29.25 
 
 		 711 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  28.57 
 
 		 721 aa  103  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  33.85 
 
 		 734 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  28.44 
 
 		 739 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  28.44 
 
 		 739 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  28.44 
 
 		 739 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.25 
 
 		 225 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  31.41 
 
 		 225 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  30.89 
 
 		 257 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  25 
 
 		 806 aa  101  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  29.42 
 
 		 539 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  24.6 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.7 
 
 		 221 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.49 
 
 		 247 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  30.73 
 
 		 225 aa  100  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  33.85 
 
 		 211 aa  100  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  25.86 
 
 		 753 aa  99.4  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  26.59 
 
 		 477 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.92 
 
 		 247 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4959  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  29.95 
 
 		 247 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000799386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5553  capsular polysaccharide biosynthesis  29.33 
 
 		 247 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000105771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5452  chain length regulator  29.95 
 
 		 247 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  29.02 
 
 		 727 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  25.38 
 
 		 716 aa  97.8  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.54 
 
 		 215 aa  97.8  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  28.18 
 
 		 234 aa  97.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  29.43 
 
 		 743 aa  97.1  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  28.57 
 
 		 247 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  29.84 
 
 		 225 aa  96.7  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5074  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.03 
 
 		 247 aa  96.7  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  27.01 
 
 		 726 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  32.88 
 
 		 763 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  29.9 
 
 		 753 aa  96.3  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.99 
 
 		 720 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.37 
 
 		 235 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3269  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 		 223 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.316861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  30.21 
 
 		 225 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.38 
 
 		 240 aa  94.7  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  32.29 
 
 		 246 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  27.76 
 
 		 727 aa  94  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  26.77 
 
 		 739 aa  93.2  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  28.18 
 
 		 734 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  29.66 
 
 		 745 aa  92.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  25 
 
 		 721 aa  91.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  26.4 
 
 		 736 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  28.18 
 
 		 524 aa  91.3  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  26.15 
 
 		 741 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  25.16 
 
 		 737 aa  91.3  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.85 
 
 		 741 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  25.85 
 
 		 741 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.15 
 
 		 741 aa  90.9  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  25.85 
 
 		 741 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  25.85 
 
 		 741 aa  90.5  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  26.83 
 
 		 756 aa  90.5  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>