122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0540 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0540  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 232 aa  454  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.89 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  35.27 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.55 
 
 		 221 aa  138  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.11 
 
 		 247 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5452  chain length regulator  36 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5553  capsular polysaccharide biosynthesis  36 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000105771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  31.53 
 
 		 464 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4959  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  35.56 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000799386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.67 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  35.04 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5074  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.11 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  34.62 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1069  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.3 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.62909  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  30.04 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  29.31 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3269  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.99 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.316861  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1173  cpsC protein  32.44 
 
 		 230 aa  108  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.44 
 
 		 482 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1435  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.12 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  28.44 
 
 		 466 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2652  lipopolysaccharide biosynthesis  28.18 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0918  capsule chain length determinant protein  28.99 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000182566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  28.88 
 
 		 492 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  29.41 
 
 		 508 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  28.57 
 
 		 505 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1156  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 		 286 aa  91.3  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000219434  hitchhiker  4.797860000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2688  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.15 
 
 		 220 aa  89.7  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2745  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.15 
 
 		 220 aa  89.7  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1646  chain length determinant protein  26.91 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0135  MPA1 family polysaccharide export protein  32.31 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0140  MPA1 family polysaccharide export protein  32.31 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2856  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.8 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.85 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000403429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 		 480 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3699  chain length determinant protein  26.22 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1678  chain length determinant protein  26.01 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1464  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  26.01 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000744364  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1506  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.58 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.221865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1491  chain length determinant protein  26.46 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1609  chain length determinant protein  26.46 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  23.58 
 
 		 496 aa  82.8  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2448  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.89 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0667575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  25.1 
 
 		 529 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  25.55 
 
 		 521 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  24.89 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  22.17 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  25.13 
 
 		 490 aa  72.4  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0501  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 		 488 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.056909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  29.52 
 
 		 473 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  23.4 
 
 		 667 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  25.59 
 
 		 615 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12760  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.392937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1944  lipopolysaccharide biosynthesis  26.84 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  29.75 
 
 		 605 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  36.49 
 
 		 779 aa  64.3  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  26.32 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  30.25 
 
 		 624 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 524 aa  63.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  38.96 
 
 		 736 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  25.22 
 
 		 438 aa  61.6  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  26.26 
 
 		 497 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1820  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00000660961  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  29.63 
 
 		 472 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.57 
 
 		 474 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1179  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.33 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  19.23 
 
 		 477 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.05 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  29.58 
 
 		 711 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  31.96 
 
 		 443 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  29.41 
 
 		 790 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  34.67 
 
 		 741 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  23.53 
 
 		 484 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0243  lipopolysaccharide biosynthesis  39.39 
 
 		 463 aa  52.4  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  32.58 
 
 		 466 aa  52  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  35.06 
 
 		 730 aa  52  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  32.47 
 
 		 742 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 756 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1712  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.47 
 
 		 435 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.661952  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  18.7 
 
 		 478 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 721 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  22.69 
 
 		 539 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  29.41 
 
 		 815 aa  50.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1405  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.39 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.148993  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  31.03 
 
 		 745 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  20.35 
 
 		 804 aa  48.9  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 		 643 aa  49.3  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 		 642 aa  49.3  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  25.6 
 
 		 722 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2347  lipopolysaccharide biosynthesis  27.78 
 
 		 426 aa  48.9  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000937745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1446  lipopolysaccharide biosynthesis  31.65 
 
 		 519 aa  48.5  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  23.41 
 
 		 503 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0165  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 		 386 aa  48.5  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  29.58 
 
 		 727 aa  48.5  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  34.33 
 
 		 472 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2580  lipopolysaccharide biosynthesis protein  40 
 
 		 520 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  28.92 
 
 		 445 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  32.47 
 
 		 750 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 453 aa  46.6  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1372  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26 
 
 		 209 aa  46.2  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.482281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>