79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2274 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2274  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
315 aa  619  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1712  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.68 
 
 
435 aa  99  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.661952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2347  lipopolysaccharide biosynthesis  31.75 
 
 
426 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000937745  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  25.42 
 
 
445 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.64 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.39 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.27 
 
 
247 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22900  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  24.26 
 
 
753 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  24.72 
 
 
247 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5553  capsular polysaccharide biosynthesis  25.28 
 
 
247 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000105771  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4959  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  24.72 
 
 
247 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000799386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5074  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 
247 aa  59.7  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  29.14 
 
 
232 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5452  chain length regulator  24.16 
 
 
247 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  24.72 
 
 
247 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  42.19 
 
 
232 aa  56.6  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.37 
 
 
653 aa  56.2  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  25.62 
 
 
624 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0357  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  27.91 
 
 
234 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0918  capsule chain length determinant protein  44.9 
 
 
237 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000182566  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1646  chain length determinant protein  25.68 
 
 
247 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  24.47 
 
 
509 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.49 
 
 
474 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0945  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.81 
 
 
625 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  27.06 
 
 
711 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  29.85 
 
 
804 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 
221 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33.33 
 
 
726 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33.33 
 
 
726 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33.33 
 
 
726 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33.33 
 
 
726 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33.33 
 
 
726 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33.33 
 
 
726 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.7 
 
 
463 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1435  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22890  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 
380 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  29.9 
 
 
764 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  33.33 
 
 
726 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  27.46 
 
 
472 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 
726 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  31.34 
 
 
790 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1156  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.69 
 
 
286 aa  46.6  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000219434  hitchhiker  4.797860000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  40.62 
 
 
740 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  24.9 
 
 
487 aa  46.2  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  29.79 
 
 
722 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3133  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.96 
 
 
588 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22870  hypothetical protein  24.24 
 
 
199 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  32.22 
 
 
784 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.56 
 
 
575 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.64 
 
 
780 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  23.64 
 
 
781 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  25 
 
 
464 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  26.89 
 
 
815 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1653  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0595159  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1457  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.91 
 
 
576 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3699  chain length determinant protein  23.96 
 
 
247 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290655  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  33.33 
 
 
753 aa  43.9  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0419  chain length determinant protein  23.25 
 
 
370 aa  43.9  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.554474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  25.56 
 
 
753 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  25.86 
 
 
740 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  23.26 
 
 
797 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1571  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.79 
 
 
371 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.647884  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  26.61 
 
 
815 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1678  chain length determinant protein  24.08 
 
 
247 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1464  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  24.08 
 
 
247 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000744364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  23.36 
 
 
735 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  27.38 
 
 
757 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3175  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.71 
 
 
710 aa  43.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.659876  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  33.33 
 
 
736 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  23.14 
 
 
774 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  21.7 
 
 
814 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350341  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2809  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.5 
 
 
405 aa  42.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  26.72 
 
 
747 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2235  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.53 
 
 
396 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  27.66 
 
 
721 aa  42.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 
730 aa  42.4  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  26.67 
 
 
767 aa  42.4  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>